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    Prediction model construction of mouse stem cell pluripotency using CpG and non-CpG DNA methylation markers
    Joe, Soobok ; Nam, Hojung
    In: BMC Bioinformatics, Jg. 21 (2020-05-01), Heft 1, S. 1-12
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    CpGcluster: a distance-based algorithm for CpG-island detection
    Hackenberg, Michael ; Oliver, José L. ; et al.
    In: BMC Bioinformatics, Jg. 7 (2006-10-01), Heft 1
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    CpG islands or CpG clusters: how to identify functional GC-rich regions in a genome?
    Zhao, Zhongming ; Han, Leng
    In: BMC Bioinformatics, Jg. 10 (2009-02-01), S. 65-65
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    A novel k-mer mixture logistic regression for methylation susceptibility modeling of CpG dinucleotides in human gene promoters
    Nephew, Kenneth P. ; Yang, Youngik ; et al.
    In: BMC Bioinformatics, Jg. 13 (2012-03-01), Heft Suppl 3, S. S15
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    Methylation Linear Discriminant Analysis (MLDA) for identifying differentially methylated CpG islands
    Teodoridis, Jens M. ; Brown, Robert S. ; et al.
    In: BMC Bioinformatics, Jg. 9 (2008-08-01), S. 337-337
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    A novel nonparametric computational strategy for identifying differential methylation regions
    Sun, Xifang ; Wang, Donglin ; et al.
    In: BMC Bioinformatics, Jg. 23 (2022), S. 1-10
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    Walking pathways with positive feedback loops reveal DNA methylation biomarkers of colorectal cancer
    Leskov, Leonid S. ; Kel, Alexander E. ; et al.
    In: BMC Bioinformatics, Jg. 20 (2019-04-01), S. 1-20
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    A model of pulldown alignments from SssI-treated DNA improves DNA methylation prediction
    Moreland, Blythe ; Bundschuh, Ralf ; et al.
    In: BMC Bioinformatics, Jg. 20 (2019-08-01), Heft 1, S. 1-15
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    Estimation of CpG coverage in whole methylome next-generation sequencing studies
    McClay, Joseph L. ; Aberg, Karolina A. ; et al.
    In: BMC Bioinformatics, Jg. 14, Heft 1, S. 50-50
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    Screening genome-wide DNA methylation CpG sites via training and testing data utilizing surrogate variables
    Ray, Meredith ; Zhang, Hongmei ; et al.
    In: BMC Bioinformatics, Jg. 15, Heft Suppl 10, S. P4
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    Comparison of different cell type correction methods for genome-scale epigenetics studies
    Karmaus, Wilfried ; Zhang, Hongmei ; et al.
    In: BMC Bioinformatics, Jg. 18 (2017-04-01), Heft 1, S. 1-12
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    Epigenetic machine learning: utilizing DNA methylation patterns to predict spastic cerebral palsy
    Akins, Robert E. ; Marsh, Adam G. ; et al.
    In: BMC Bioinformatics, Jg. 19 (2018-06-01), Heft 1, S. 1-10
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    MeDEStrand: an improved method to infer genome-wide absolute methylation levels from DNA enrichment data
    Dai, Yang ; Bulun, Serdar E. ; et al.
    In: BMC Bioinformatics, Jg. 19 (2018-12-01)
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    pwrEWAS: a user-friendly tool for comprehensive power estimation for epigenome wide association studies (EWAS)
    Graw, Stefan ; Thompson, Jeffrey ; et al.
    In: BMC Bioinformatics, Jg. 20 (2019-04-01)
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    An information-theoretic approach to the modeling and analysis of whole-genome bisulfite sequencing data
    Feinberg, Andrew P. ; Jenkinson, Garrett ; et al.
    In: BMC Bioinformatics, Jg. 19 (2018-03-01), Heft 1, S. 1-23
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    Simulating ComBat: how batch correction can lead to the systematic introduction of false positive results in DNA methylation microarray studies
    Zindler, Tristan ; Bleich, Stefan ; et al.
    In: BMC Bioinformatics, Jg. 21 (2020-06-01)
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    ChARM: Discovery of combinatorial chromatin modification patterns in hepatitis B virus X-transformed mouse liver cancer using association rule mining
    Park, Sung-Hee ; Kim, Sangsoo ; et al.
    In: BMC Bioinformatics, Jg. 17 (2016-12-01), Heft Suppl 16
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    Improving cell mixture deconvolution by identifying optimal DNA methylation libraries (IDOL)
    Wiencke, John K. ; Koestler, Devin C. ; et al.
    In: BMC Bioinformatics, Jg. 17 (2016-03-01)
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    Identifying differentially methylated genes using mixed effect and generalized least square models
    Yan, Pearlly S. ; Lin, Shili ; et al.
    In: BMC Bioinformatics, Jg. 10 (2009-12-01), Heft 1
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    Using beta-binomial regression for high-precision differential methylation analysis in multifactor whole-genome bisulfite sequencing experiments
    Dolzhenko, Egor ; Smith, Andrew D.
    In: BMC Bioinformatics, Jg. 15 (2014-06-01), S. 215-215
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