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    Maboss for HPC environments: implementations of the continuous time Boolean model simulator for large CPU clusters and GPU accelerators
    Šmelko, Adam ; Kratochvíl, Miroslav ; et al.
    In: BMC Bioinformatics, Jg. 25 (2024-05-01), Heft 1, S. 1-15
    Online academicJournal
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    academicJournal
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    BLAMM: BLAS-based algorithm for finding position weight matrix occurrences in DNA sequences on CPUs and GPUs
    Fostier, Jan
    In: BMC Bioinformatics, Jg. 21 (2020-03-01), Heft S2, S. 1-13
    Online academicJournal
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    BLAMM: BLAS-based algorithm for finding position weight matrix occurrences in DNA sequences on CPUs and GPUs
    Fostier, Jan
    In: BMC Bioinformatics, Jg. 21 (2020-03-11), Heft Suppl 2
    Online academicJournal
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    cmFSM: a scalable CPU-MIC coordinated drug-finding tool by frequent subgraph mining
    Yang, Shunyun ; Guo, Runxin ; et al.
    In: BMC Bioinformatics, Jg. 19 (2018-05-01), Heft S4, S. 35-47
    Online academicJournal
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    CmFSM: a scalable CPU-MIC coordinated drug-finding tool by frequent subgraph mining
    Yang, Shunyun ; Guo, Runxin ; et al.
    In: BMC bioinformatics, Jg. 19 (2018), Heft 4, S. 35-47
    Online serialPeriodical
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    CMSA: a heterogeneous CPU/GPU computing system for multiple similar RNA/DNA sequence alignment
    Chen, Xi ; Wang, Chen ; et al.
    In: BMC Bioinformatics, Jg. 18 (2017-06-01), Heft 1, S. 1-10
    Online academicJournal
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    Volltext (PDF)
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    CMSA: a heterogeneous CPU/GPU computing system for multiple similar RNA/DNA sequence alignment
    Chen, Xi ; Wang, Chen ; et al.
    In: BMC bioinformatics, Jg. 18 (2017), Heft 1, S. 1-10
    Online serialPeriodical
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    Volltext (PDF)
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    muBLASTP: database-indexed protein sequence search on multicore CPUs.
    Zhang, Jing ; Misra, Sanchit ; et al.
    In: BMC Bioinformatics, Jg. 17 (2016-11-04), S. 1-14
    Online academicJournal
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    rapidGSEA: Speeding up gene set enrichment analysis on multi-core CPUs and CUDA-enabled GPUs
    Hildebrandt, Andreas ; Schmidt, Bertil ; et al.
    In: BMC Bioinformatics, Jg. 17 (2016-09-01)
    Online unknown
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    muBLASTP: database-indexed protein sequence search on multicore CPUs
    Misra, Sanchit ; Feng, Wu-chun ; et al.
    In: BMC Bioinformatics, Jg. 17 (2016-11-01)
    Online unknown
    Zugriff:
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    CUDASW++ 3.0: accelerating Smith-Waterman protein database search by coupling CPU and GPU SIMD instructions.
    Liu, Yongchao ; Wirawan, Adrianto ; et al.
    In: BMC Bioinformatics, Jg. 14 (2013-05-01), Heft 1, S. 1-10
    Online academicJournal
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  17. Detailansicht für Treffer 17 öffnen
    GPU acceleration of Darwin read overlapper for de novo assembly of long DNA reads
    Ahmed, Nauman ; Qiu, Tong Dong ; et al.
    In: BMC Bioinformatics, Jg. 21 (2020-09-17), Heft Suppl 13
    Online academicJournal
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  18. Detailansicht für Treffer 18 öffnen
    Computational comparison of common event-based differential splicing tools: practical considerations for laboratory researchers
    Jansen, Gerrit ; Cloos, Jacqueline ; et al.
    In: BMC Bioinformatics, Jg. 22 (2021-06-26), Heft 1
    Online unknown
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    Scaling bioinformatics applications on HPC
    Petrick, Nicholas ; Tong, Weida ; et al.
    In: BMC Bioinformatics, Jg. 18 (2017-12-01), S. 163-169
    Online unknown
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    CAREx: context-aware read extension of paired-end sequencing data.
    Kallenborn, Felix ; Schmidt, Bertil
    In: BMC Bioinformatics, Jg. 25 (2024-05-10), Heft 1, S. 1-18
    Online academicJournal
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