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    LTQ-iQuant: A freely available software pipeline for automated and accurate protein quantification of isobaric tagged peptide data from LTQ instruments
    ONSONGO, Getiria ; STONE, Matthew D ; et al.
    In: Proteomics (Weinheim. Print), Jg. 10 (2010), Heft 19, S. 3533-3538
    Online academicJournal
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    Effect of mass spectrometric parameters on peptide and protein identification rates for shotgun proteomic experiments on an LTQ-orbitrap mass analyzer
    KALLI, Anastasia ; HESS, Sonja
    In: Proteomics (Weinheim. Print), Jg. 12 (2012), Heft 1, S. 21-31
    Online academicJournal
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    Analysis of low complex region peptides derived from mollusk shell matrix proteins using CID, high-energy collisional dissociation, and electron transfer dissociation on an LTQ-orbitrap: Implications for peptide to spectrum match
    MARIE, Arul ; ALVES, Sandra ; et al.
    In: Proteomics (Weinheim. Print), Jg. 12 (2012), Heft 19-20, S. 3069-3075
    Online academicJournal
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    Increasing the mass accuracy of high-resolution LC-MS data using background ions : a case study on the LTQ-Orbitrap
    SCHELTEMA, Richard A ; KAMLEH, Anas ; et al.
    In: Proteomics (Weinheim. Print), Jg. 8 (2008), Heft 22, S. 4647-4656
    Online academicJournal
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    Proteomic characterization of the abdominal ganglion of Aplysia californica―A protein resource for neuroscience : FOCUS ON BRAIN PROTEINS AND PROTEOMICS
    BIRNER-GRUENBERGER, Ruth ; DARNHOFER, Barbara ; et al.
    In: Proteomics (Weinheim. Print), Jg. 12 (2012), Heft 15-16, S. 2482-2486
    Online academicJournal
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    iTRAQ-based quantitative analysis of protein mixtures with large fold change and dynamic range
    CASADO-VELA, Juan ; MARTANEZ-ESTESO, María José ; et al.
    In: Proteomics (Weinheim. Print), Jg. 10 (2010), Heft 2, S. 343-347
    Online academicJournal
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    Profiling human brain proteome by multi-dimensional separations coupled with MS
    YOUNG MOK, PARK ; JIN YOUNG, KIM ; et al.
    In: The HUPO Brain Proteome Project: Concerted proteome analysis of the brain, Jg. 6 (2006), Heft 18, S. 4978-4986
    Online academicJournal
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    Concanavalin A-immobilized magnetic nanoparticles for selective enrichment of glycoproteins and application to glycoproteomics in hepatocelluar carcinoma cell line
    JIA, TANG ; YANG, LIU ; et al.
    In: Proteomics (Weinheim. Print), Jg. 10 (2010), Heft 10, S. 2000-2014
    Online academicJournal
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    High-accuracy identification and bioinformatic analysis of in vivo protein phosphorylation sites in yeast
    GNAD, Florian ; DE GODOY, Lyris M. F ; et al.
    In: Yeast Proteomics, Jg. 9 (2009), Heft 20, S. 4642-4652
    Online academicJournal
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    A study of glycoproteins in human serum and plasma reference standards (HUPO) using multilectin affinity chromatography coupled with RPLC-MS/MS
    ZIPING, YANG ; HANCOCK, William S ; et al.
    In: Exploring the Human Plasma Proteome: The HUPO Plasma Proteome Project (HPPP), Jg. 5 (2005), Heft 13, S. 3353-3366
    Online academicJournal
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    Workflow for analysis of high mass accuracy salivary data set using MaxQuant and ProteinPilot search algorithm
    JAGTAP, Pratik ; BANDHAKAVI, Sricharan ; et al.
    In: Proteomics (Weinheim. Print), Jg. 12 (2012), Heft 11, S. 1726-1730
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    Integrated platform for manual and high-throughput statistical validation of tandem mass spectra
    KEBING, YU ; SABELLI, Anthony ; et al.
    In: Proteomics (Weinheim. Print), Jg. 9 (2009), Heft 11, S. 3115-3125
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    Identification of carbonylated proteins from enriched rat skeletal muscle mitochondria using affinity chromatography-stable isotope labeling and tandem mass spectrometry
    MEANY, Danni L ; HONGWEI, XIE ; et al.
    In: Proteomics (Weinheim. Print), Jg. 7 (2007), Heft 7, S. 1150-1163
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    Secretome analysis of the fungus Trichoderma harzianum grown on cellulose
    DO VALE, Luis H. F ; GOMEZ-MENDOZA, Diana P ; et al.
    In: Proteomics in Brazil, Jg. 12 (2012), Heft 17, S. 2716-2728
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    Mass spectrometric characterization of recombinant rat 5-hydroxytryptamine receptor 1A (5-HT1AR) expressed in tsA201 human embryonic kidney cells
    HEO, Seok ; YANG, Jae-Won ; et al.
    In: Proteomics (Weinheim. Print), Jg. 12 (2012), Heft 22, S. 3338-3342
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    Systematic evaluation of alternating CID and ETD fragmentation for phosphorylated peptides
    KIM, Min-Sik ; JUN, ZHONG ; et al.
    In: Proteomics (Weinheim. Print), Jg. 11 (2011), Heft 12, S. 2568-2572
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    Comprehensive proteomic analysis of human bile
    BARBHUIYA, Mustafa A ; SAHASRABUDDHE, Nandini A ; et al.
    In: Proteomics (Weinheim. Print), Jg. 11 (2011), Heft 23, S. 4443-4453
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    A systematic analysis of the effects of increasing degrees of serum immunodepletion in terms of depth of coverage and other key aspects in top-down and bottom-up proteomic analyses
    WELBERRY SMITH, Matthew P ; WOOD, Steven L ; et al.
    In: Proteomics (Weinheim. Print), Jg. 11 (2011), Heft 11, S. 2222-2235
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    Pseudo-neutral-loss scan for selective detection of phosphopeptides and N-glycopeptides using liquid chromatography coupled with a hybrid linear ion-trap/ orbitrap mass spectrometer
    HSIAO, He-Hsuan ; URLAUB, Henning
    In: Proteomics (Weinheim. Print), Jg. 10 (2010), Heft 21, S. 3916-3921
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    Differential protein expression on the cell surface of colorectal cancer cells associated to tumor metastasis
    LUQUE-GARCIA, Jose Luis ; MARTINEZ-TORRECUADRADA, Jorge Luis ; et al.
    In: Proteomics (Weinheim. Print), Jg. 10 (2010), Heft 5, S. 940-952
    Online academicJournal
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