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    Inpactor2: a software based on deep learning to identify and classify LTR-retrotransposons in plant genomes.
    Orozco-Arias, Simon ; Lopez-Murillo, Luis Humberto ; et al.
    In: Briefings in Bioinformatics, Jg. 24 (2023), Heft 1, S. 1-10
    Online academicJournal
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    A large-scale assessment of the quality of plant genome assemblies using the LTR assembly index.
    Mokhtar, Morad M ; Abd-Elhalim, Haytham M ; et al.
    In: AoB Plants, Jg. 15 (2023-06-01), Heft 3, S. 1-8
    Online academicJournal
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    Fold-LTR-TCP: protein fold recognition based on triadic closure principle.
    Liu, Bin ; Zhu, Yulin ; et al.
    In: Briefings in Bioinformatics, Jg. 21 (2020-11-01), Heft 6, S. 2185-2193
    Online academicJournal
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    iCircDA-LTR: identification of circRNA–disease associations based on Learning to Rank.
    Wei, Hang ; Xu, Yong ; et al.
    In: Bioinformatics, Jg. 37 (2021-10-01), Heft 19, S. 3302-3310
    Online academicJournal
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    Becoming a Selfish Clan: Recombination Associated to Reverse-Transcription in LTR Retrotransposons.
    Drost, Hajk-Georg ; Sanchez, Diego H
    In: Genome Biology & Evolution, Jg. 11 (2019-12-01), Heft 12, S. 3382-3392
    Online academicJournal
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    TE-greedy-nester: structure-based detection of LTR retrotransposons and their nesting.
    Lexa, Matej ; Jedlicka, Pavel ; et al.
    In: Bioinformatics, Jg. 36 (2020-10-15), Heft 20, S. 4991-4999
    Online academicJournal
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    Birth and Death of LTR-Retrotransposons in Aegilops tauschii.
    Dai, Xiongtao ; Wang, Hao ; et al.
    In: Genetics, Jg. 210 (2018-11-01), Heft 3, S. 1039-1051
    Online academicJournal
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    Rapid and Recent Evolution of LTR Retrotransposons Drives Rice Genome Evolution During the Speciation of AA-Genome Oryza Species.
    Zhang, Qun-Jie ; Gao, Li-Zhi
    In: G3: Genes | Genomes | Genetics, Jg. 7 (2017-06-01), Heft 6, S. 1875-1885
    Online academicJournal
    Zugriff:
    Volltext (PDF)
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    LTR_retriever: A Highly Accurate and Sensitive Program for Identification of Long Terminal Repeat Retrotransposons.
    Ou, Shujun ; Jiang, Ning
    In: Plant Physiology, Jg. 176 (2018-02-01), Heft 2, S. 1410-1422
    Online academicJournal
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    σ<subscript>marY1</subscript>, the LTR of the gypsy-Type Retroelement marY1 from the Basidiomycete Tricholoma matsutake, Allows Multicopy DNA Integration in Lentinula edodes.
    Murata, Hitoshi ; Miyazaki, Yasumasa
    In: Bioscience, Biotechnology & Biochemistry, Jg. 68 (2004), Heft 1, S. 218-221
    Online academicJournal
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    LTR Retrotransposons Show Low Levels of Unequal Recombination and High Rates of Intraelement Gene Conversion in Large Plant Genomes.
    Cossu, Rosa Maria ; Casola, Claudio ; et al.
    In: Genome Biology & Evolution, Jg. 9 (2017-12-01), Heft 12, S. 3449-3462
    Online academicJournal
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    Origination of LTR Retroelement–Derived NYNRIN Coincides with Therian Placental Emergence.
    Plianchaisuk, Arnon ; Kusama, Kazuya ; et al.
    In: Molecular Biology & Evolution, Jg. 39 (2022-09-01), Heft 9, S. 1-17
    Online academicJournal
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    Simulation-based estimation of branching models for LTR retrotransposons.
    Moulin, Serge ; Seux, Nicolas ; et al.
    In: Bioinformatics, Jg. 33 (2017-02-01), Heft 3, S. 320-326
    Online academicJournal
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    Transcriptional Dynamics of LTR Retrotransposons in Early Generation and Ancient Sunflower Hybrids.
    Ungerer, Mark C. ; Kawakami, Takeshi
    In: Genome Biology & Evolution, Jg. 5 (2013-02-01), Heft 2, S. 329-337
    Online academicJournal
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    LTR Retrotransposons Contribute to Genomic Gigantism in Plethodontid Salamanders.
    Sun, Cheng ; Shepard, Donald B. ; et al.
    In: Genome Biology & Evolution, Jg. 4 (2012-09-01), Heft 9, S. 168-183
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    Identification and Characterization of Rhizot, a Novel LTR Retrotransposon of Rhizopus oryzae and R. delemar.
    Abe, Ayurni ; Asano, Kozo ; et al.
    In: Bioscience, Biotechnology & Biochemistry, Jg. 73 (2009-08-01), Heft 8, S. 1860-1862
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    Accumulation and Rapid Decay of Non-LTR Retrotransposons in the Genome of the Three-Spine Stickleback.
    Blass, Eryn ; Bell, Michael ; et al.
    In: Genome Biology & Evolution, Jg. 4 (2012-09-01), Heft 9, S. 687-702
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    Application of learning to rank in bioinformatics tasks.
    Ru, Xiaoqing ; Ye, Xiucai ; et al.
    In: Briefings in Bioinformatics, Jg. 22 (2021-09-01), Heft 5, S. 1-11
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    Origin and Evolution of Plant Long Terminal Repeat Retrotransposons with Additional Ribonuclease H.
    Biryukov, Mikhail ; Ustyantsev, Kirill
    In: Genome Biology & Evolution, Jg. 15 (2023-09-01), Heft 9, S. 1-8
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    Unearthing LTR Retrotransposon gag Genes Co-opted in the Deep Evolution of Eukaryotes.
    Wang, Jianhua ; Han, Guan-Zhu
    In: Molecular Biology & Evolution, Jg. 38 (2021-08-01), Heft 8, S. 3267-3278
    Online academicJournal
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