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    Bagging MSA Learning: Enhancing Low-Quality PSSM with Deep Learning for Accurate Protein Structure Property Prediction
    Huang, Junzhou ; Wang, Sheng ; et al.
    2020
    Online unknown
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    ProgSIO-MSA: Progressive-based single iterative optimization framework for multiple sequence alignment using an effective scoring system
    Bankapur, Sanjay ; Patil, Nagamma
    In: Journal of Bioinformatics and Computational Biology, Jg. 18 (2020-04-01), S. 2050005-2050005
    Online unknown
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    Wie komme ich dran?
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    STRIKE: evaluation of protein MSAs using a single 3D structure
    Kemena, Carsten ; Notredame, Cedric ; et al.
    In: Bioinformatics, Jg. 27 (2011), Heft 24, S. 3385-3391
    Online unknown
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    Extending the Horizon of Homology Detection with Coevolution-based Structure Prediction
    Sanchez-Pulido, Luis ; Ponting, Chris P.
    In: Journal of molecular biology, Jg. 433 (2021-04-28), Heft 20
    Online unknown
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    Wie komme ich dran?
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    AlignmentViewer: Sequence Analysis of Large Protein Families
    Sheridan, Rob ; Luna, Augustin ; et al.
    In: F1000Research, Jg. 9 (2020-10-15), S. 213-213
    Online unknown
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    Improving multiple sequence alignment biological accuracy through genetic algorithms
    Guirado, Fernando ; Notredame, Cedric ; et al.
    Online unknown
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    Volltext
    Wie komme ich dran?
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    NGlyAlign: an automated library building tool to align highly divergent HIV envelope sequences
    Akand, Elma H. ; Murray, John M.
    In: BMC Bioinformatics, Jg. 22 (2021-02-01), Heft 1, S. 1-14
    Online unknown
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    MAGUS: Multiple sequence Alignment using Graph clUStering
    Smirnov, Vladimir ; Warnow, Tandy
    In: Bioinformatics, Jg. 37 (2020-11-01), Heft 12, S. 1666-1672
    Online unknown
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    EPTool: A New Enhancing PSSM Tool for Protein Secondary Structure Prediction
    Ma, Hehuan ; Guo, Yuzhi ; et al.
    In: Journal of Computational Biology, Jg. 28 (2021-04-01), S. 362-364
    Online unknown
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    Post-Alignment Adjustment and Its Automation
    Xia, Xuhua
    In: Genes, Jg. 12 (2021-11-01), Heft 1809
    Online unknown
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    SpliVert: A Protein Multiple Sequence Alignment Refinement Method Based on Splitting-Splicing Vertically
    Jiang, Qinghua ; Wang, Yadong ; et al.
    In: Protein & Peptide Letters, Jg. 27 (2020-03-17), S. 295-302
    Online unknown
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    DeepECA: an end-to-end learning framework for protein contact prediction from a multiple sequence alignment
    Fukuda, Hiroyuki ; Tomii, Kentaro
    In: BMC Bioinformatics, Jg. 21 (2020), Heft 1, S. 1-15
    Online unknown
    Zugriff:
    Volltext (PDF)
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    DeepMSA: constructing deep multiple sequence alignment to improve contact prediction and fold-recognition for distant-homology proteins
    Li, Yang ; Zhang, Yang ; et al.
    In: Bioinformatics, Jg. 36 (2019-11-18), S. 2105-2112
    Online unknown
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    Analysis of several key factors influencing deep learning-based inter-residue contact prediction
    Adhikari, Badri ; Hou, Jie ; et al.
    In: Bioinformatics, Jg. 36 (2019-08-30), S. 1091-1098
    Online unknown
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    Ensembling multiple raw coevolutionary features with deep residual neural networks for contact‐map prediction in CASP13
    Zhang, Yang ; Bell, Eric W. ; et al.
    In: Proteins: Structure, Function, and Bioinformatics, Jg. 87 (2019-08-22), S. 1082-1091
    Online unknown
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    GMSA: A Data Sharing System for Multiple Sequence Alignment Across Multiple Users
    Bai, Na ; Chen, Xi ; et al.
    In: Current Bioinformatics, Jg. 14 (2019-07-16), S. 504-515
    Online unknown
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    Bios2cor: an R package integrating dynamic and evolutionary correlations to identify functionally important residues in proteins
    Taddese, Bruck ; Henrion, Daniel ; et al.
    2021
    Online unknown
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    Generating functional protein variants with variational autoencoders
    Hawkins-Hooker, Alex ; Chen, Arthur ; et al.
    2021
    Online unknown
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    Improving deep learning-based protein distance prediction in CASP14
    Wu, Tianqi ; Liu, Jian ; et al.
    2021
    Online unknown
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    Protein contact prediction using metagenome sequence data and residual neural networks
    Wu, Qi ; Yang, Jianyi ; et al.
    In: Bioinformatics, Jg. 36 (2019-06-07), S. 41-48
    Online unknown
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