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    RCSB Protein Data Bank: Efficient Searching and Simultaneous Access to One Million Computed Structure Models Alongside the PDB Structures Enabled by Architectural Advances.
    Bittrich, S ; Bhikadiya, C ; et al.
    In: Journal of molecular biology, Jg. 435 (2023-07-15), Heft 14, S. 167994
    academicJournal
    Wie komme ich dran?
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    RCSB Protein Data Bank: Celebrating 50 years of the PDB with new tools for understanding and visualizing biological macromolecules in 3D.
    Burley, SK ; Bhikadiya, C ; et al.
    In: Protein science : a publication of the Protein Society, Jg. 31 (2022), Heft 1, S. 187-208
    Online academicJournal
    Zugriff:
    Full Text Finder (Volltext)
    Wie komme ich dran?
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    New restraints and validation approaches for nucleic acid structures in PDB-REDO.
    de Vries I ; Kwakman, T ; et al.
    In: Acta crystallographica. Section D, Structural biology, Jg. 77 (2021-09-01), Heft Pt 9, S. 1127-1141
    Online academicJournal
    Zugriff:
    Volltext (PDF)
    Wie komme ich dran?
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    RCSB Protein Data Bank: Architectural Advances Towards Integrated Searching and Efficient Access to Macromolecular Structure Data from the PDB Archive.
    Rose, Y ; Duarte, JM ; et al.
    In: Journal of molecular biology, Jg. 433 (2021-05-28), Heft 11, S. 166704
    academicJournal
    Wie komme ich dran?
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    On the evolution of the quality of macromolecular models in the PDB.
    Brzezinski, D ; Dauter, Z ; et al.
    In: The FEBS journal, Jg. 287 (2020-07-01), Heft 13, S. 2685-2698
    Online academicJournal
    Zugriff:
    Volltext (PDF)
    Siehe Detailanzeige für Volltext
    Wie komme ich dran?
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    Facilities that make the PDB data collection more powerful.
    Lange, J ; Baakman, C ; et al.
    In: Protein science : a publication of the Protein Society, Jg. 29 (2020), Heft 1, S. 330-344
    Online academicJournal
    Zugriff:
    Full Text Finder (Volltext)
    Wie komme ich dran?
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    ConSurf-DB: An accessible repository for the evolutionary conservation patterns of the majority of PDB proteins.
    Ben Chorin, A ; Masrati, G ; et al.
    In: Protein science : a publication of the Protein Society, Jg. 29 (2020), Heft 1, S. 258-267
    Online academicJournal
    Zugriff:
    Full Text Finder (Volltext)
    Wie komme ich dran?
  8. Detailansicht für Treffer 8 öffnen
    Homology-based hydrogen bond information improves crystallographic structures in the PDB.
    van Beusekom B ; Touw, WG ; et al.
    In: Protein science : a publication of the Protein Society, Jg. 27 (2018-03-01), Heft 3, S. 798-808
    Online academicJournal
    Zugriff:
    Full Text Finder (Volltext)
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    PDB-wide identification of biological assemblies from conserved quaternary structure geometry.
    Dey, S ; Ritchie, DW ; et al.
    In: Nature methods, Jg. 15 (2018), Heft 1, S. 67-72
    Online academicJournal
    Zugriff:
    View record at Springer (Volltext)
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    A Systematic Analysis of the Structures of Heterologously Expressed Proteins and Those from Their Native Hosts in the RCSB PDB Archive.
    Zhou, RB ; Lu, HM ; et al.
    In: PloS one, Jg. 11 (2016-08-12), Heft 8, S. e0161254
    Online academicJournal
    Zugriff:
    Volltext (PDF)
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    PhyreStorm: A Web Server for Fast Structural Searches Against the PDB.
    Mezulis, S ; Sternberg, MJE ; et al.
    In: Journal of molecular biology, Jg. 428 (2016-02-22), Heft 4, S. 702-708
    academicJournal
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    RCSB PDB Mobile: iOS and Android mobile apps to provide data access and visualization to the RCSB Protein Data Bank.
    Quinn, GB ; Bi, C ; et al.
    In: Bioinformatics (Oxford, England), Jg. 31 (2015), Heft 1, S. 126-7
    Online academicJournal
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    A PDB-wide, evolution-based assessment of protein-protein interfaces.
    Baskaran, K ; Duarte, JM ; et al.
    In: BMC structural biology, Jg. 14 (2014-10-18), S. 22
    Online academicJournal
    Zugriff:
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    View record at Springer (Volltext)
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  14. Detailansicht für Treffer 14 öffnen
    sc-PDB-Frag: a database of protein-ligand interaction patterns for Bioisosteric replacements.
    Desaphy, J ; Rognan, D
    In: Journal of chemical information and modeling, Jg. 54 (2014-07-28), Heft 7, S. 1908-18
    academicJournal
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    Analysis of sequence repeats of proteins in the PDB.
    Mary Rajathei, D ; Selvaraj, S
    In: Computational biology and chemistry, Jg. 47 (2013-12-01), S. 156-66
    academicJournal
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  16. Detailansicht für Treffer 16 öffnen
    Classification of ligand molecules in PDB with fast heuristic graph match algorithm COMPLIG.
    Saito, M ; Takemura, N ; et al.
    In: Journal of molecular biology, Jg. 424 (2012-12-14), Heft 5, S. 379-90
    academicJournal
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    ESBTL: efficient PDB parser and data structure for the structural and geometric analysis of biological macromolecules.
    Loriot, S ; Cazals, F ; et al.
    In: Bioinformatics (Oxford, England), Jg. 26 (2010-04-15), Heft 8, S. 1127-8
    Online academicJournal
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    Setting up a large set of protein-ligand PDB complexes for the development and validation of knowledge-based docking algorithms.
    Diago, LA ; Morell, P ; et al.
    In: BMC bioinformatics, Jg. 8 (2007-08-25), S. 310
    Online academicJournal
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    Volltext (PDF)
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    Enhancing the functional annotation of PDB structures in PDBsum using key figures extracted from the literature.
    Laskowski, RA
    In: Bioinformatics (Oxford, England), Jg. 23 (2007-07-15), Heft 14, S. 1824-7
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    Mapping PDB chains to UniProtKB entries.
    Martin, AC
    In: Bioinformatics (Oxford, England), Jg. 21 (2005-12-01), Heft 23, S. 4297-301
    Online academicJournal
    Zugriff:
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