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    Finding motifs using DNA images derived from sparse representations.
    Chu, SK ; Stormo, GD
    In: Bioinformatics (Oxford, England), Jg. 39 (2023-06-01), Heft 6
    Online academicJournal
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    Multivariate genome-wide association analysis by iterative hard thresholding.
    Chu, BB ; Ko, S ; et al.
    In: Bioinformatics (Oxford, England), Jg. 39 (2023-04-03), Heft 4
    Online academicJournal
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    UPP2: fast and accurate alignment of datasets with fragmentary sequences.
    Park, M ; Ivanovic, S ; et al.
    In: Bioinformatics (Oxford, England), Jg. 39 (2023), Heft 1
    Online academicJournal
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    Comprehensive evaluation of noise reduction methods for single-cell RNA sequencing data.
    Chu, SK ; Zhao, S ; et al.
    In: Briefings in bioinformatics, Jg. 23 (2022-03-10), Heft 2
    Online academicJournal
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    A fast data-driven method for genotype imputation, phasing and local ancestry inference: MendelImpute.jl.
    Chu, BB ; Sobel, EM ; et al.
    In: Bioinformatics (Oxford, England), Jg. 37 (2021-12-11), Heft 24, S. 4756-4763
    Online academicJournal
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    MDA-GCNFTG: identifying miRNA-disease associations based on graph convolutional networks via graph sampling through the feature and topology graph.
    Chu, Y ; Wang, X ; et al.
    In: Briefings in bioinformatics, Jg. 22 (2021-11-05), Heft 6
    Online academicJournal
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    PredCID: prediction of driver frameshift indels in human cancer.
    Yue, Z ; Chu, X ; et al.
    In: Briefings in bioinformatics, Jg. 22 (2021-05-20), Heft 3
    Online academicJournal
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    DTI-CDF: a cascade deep forest model towards the prediction of drug-target interactions based on hybrid features.
    Chu, Y ; Kaushik, AC ; et al.
    In: Briefings in bioinformatics, Jg. 22 (2021-01-18), Heft 1, S. 451-462
    Online academicJournal
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    Weighted minimizer sampling improves long read mapping.
    Jain, C ; Rhie, A ; et al.
    In: Bioinformatics (Oxford, England), Jg. 36 (2020-07-01), Heft Suppl_1, S. i111-i118
    Online academicJournal
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    ntJoin: Fast and lightweight assembly-guided scaffolding using minimizer graphs.
    Coombe, L ; Nikolić, V ; et al.
    In: Bioinformatics (Oxford, England), Jg. 36 (2020-06-01), Heft 12, S. 3885-3887
    Online academicJournal
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    Xenbase: deep integration of GEO & SRA RNA-seq and ChIP-seq data in a model organism database.
    Fortriede, JD ; Pells, TJ ; et al.
    In: Nucleic acids research, Jg. 48 (2020-01-08), Heft D1, S. D776-D782
    Online academicJournal
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    OMMA enables population-scale analysis of complex genomic features and phylogenomic relationships from nanochannel-based optical maps.
    Leung, AK ; Liu, MC ; et al.
    In: GigaScience, Jg. 8 (2019-07-01), Heft 7
    Online academicJournal
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    IMG/M v.5.0: an integrated data management and comparative analysis system for microbial genomes and microbiomes.
    Chen, IA ; Chu, K ; et al.
    In: Nucleic acids research, Jg. 47 (2019-01-08), Heft D1, S. D666-D677
    Online academicJournal
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  14. Detailansicht für Treffer 14 öffnen
    IMG/VR v.2.0: an integrated data management and analysis system for cultivated and environmental viral genomes.
    Paez-Espino, D ; Roux, S ; et al.
    In: Nucleic acids research, Jg. 47 (2019-01-08), Heft D1, S. D678-D686
    Online academicJournal
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    ARCS: scaffolding genome drafts with linked reads.
    Yeo, S ; Coombe, L ; et al.
    In: Bioinformatics (Oxford, England), Jg. 34 (2018-03-01), Heft 5, S. 725-731
    Online academicJournal
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  16. Detailansicht für Treffer 16 öffnen
    EUPAN enables pan-genome studies of a large number of eukaryotic genomes.
    Hu, Z ; Sun, C ; et al.
    In: Bioinformatics (Oxford, England), Jg. 33 (2017-08-01), Heft 15, S. 2408-2409
    Online academicJournal
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    Pln24NT: a web resource for plant 24-nt siRNA producing loci.
    Liu, Q ; Ding, C ; et al.
    In: Bioinformatics (Oxford, England), Jg. 33 (2017-07-01), Heft 13, S. 2065-2067
    Online academicJournal
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    Kollector: transcript-informed, targeted de novo assembly of gene loci.
    Kucuk, E ; Chu, J ; et al.
    In: Bioinformatics (Oxford, England), Jg. 33 (2017-06-15), Heft 12, S. 1782-1788
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    Innovations and challenges in detecting long read overlaps: an evaluation of the state-of-the-art.
    Chu, J ; Mohamadi, H ; et al.
    In: Bioinformatics (Oxford, England), Jg. 33 (2017-04-15), Heft 8, S. 1261-1270
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    NanoSim: nanopore sequence read simulator based on statistical characterization.
    Yang, C ; Chu, J ; et al.
    In: GigaScience, Jg. 6 (2017-04-01), Heft 4, S. 1-6
    Online academicJournal
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