Fine mapping the MHC region identified rs4997052 as a new variant associated with nonobstructive azoospermia in Han Chinese males.

Objective: To investigate the association between genetic variants in the major histocompatibility complex (MHC) region and nonobstructive azoospermia (NOA) susceptibility. Design: MHC region fine-mapping analysis based on previous NOA genome-wide association study (GWAS) data. Setting: Medical university. Patient(s): Nine hundred and eighty-one men with NOA and 1,657 normal fertile male controls. Intervention(s): None. Main Outcome Measure(s): The MHC region imputation assessed with SNP2HLA software, taking the specific Han-MHC database as a reference panel; statistical significance of the MHC variants calculated using logistic regression models; functional annotation based on online public databases; and phenotypic variances explained by specific groups of genetic variants estimated using the fixed effects model from individual associations. Result(s): Two independent risk loci, rs7194 (odds ratio [OR] 1.37) at MHC class II molecules and rs4997052 (OR 1.30) at MHC class I molecules, were identified. Functional annotation showed rs7194 may tag the effect of multiple amino acid residues and the expression of HLA-DQB1 and HLA-DRB1; while rs4997052 showed the effect of amino acid changes of HLA-B at position 116 as well as the expression of HLA-B and CCHCR1, which coexpressed with genes enriched in pathways of spermatogenesis and male gamete generation. The novel variant rs4997052 identified in our study can explain another approximately 0.66% of the phenotypic variances of NOA. Conclusion(s): We fine-mapped the MHC region and identified two loci that independently drove NOA susceptibility. These results provide a deeper understanding of the association mechanisms of MHC and NOA risk. [ABSTRACT FROM AUTHOR]

Mapeo fino de la región de MHC rs4997052 identificada como una nueva variante asociada a azoospermia no obstructiva en hombres chinos han Objetivo Investigar la asociación entre variantes genéticas en la región correspondiente al complejo mayor de histocompatibilidad (MHC) y la susceptibilidad a azoospermia no obstructiva (NOA). Diseño análisis de mapeo fino de la región de MHC teniendo en cuenta los datos previos del estudio de asociación de amplificación-genómica en NOA. Lugar Universidad Médica. Paciente (s) novecientos ochenta y un paciente con diagnóstico de NOQ y 1.657 hombre con fertilidad normal como control. Intervención (es) Ninguna. Variable Resultado principal (es) La región de MHC evaluada con el software SNP2HLA, tomando como panel de referencia específico la base de datos Han-MHC; se obtuvo significancia estadística en las variantes MHC calculadas usando modelos de regresión logística; anotaciones funcionales según las bases de datos online públicas; la variación fenotípica explicada por variantes genéticas de grupos específicos usando el modelo de efectos fijos tras asociaciones individuales. Resultado (s) Se identificaron dos loci de riesgo independiente; rs7194 (odds ratio (OR):1,37) en las moléculas de clase II de MHC y rs4997052 (OR 1,30) en las moléculas de clase I de MHC. Se describió como anotación funcional que el rs7194 puede identificar el efecto de múltiples residuos de amino ácidos y la expresión del HLA-DQB1 y HLA-DRB1; mientras que el rs4997052 mostró efectos en los cambios de aminoácidos en la molécula HLA-B en posición 116, así como la expresión de HLA-B y CCHCR1, la cual se co-expresa con genes enriquecidos en vías de producción del gameto masculino y espermatogénesis. La variante novedosa rs4997052 identificada en nuestro estudio puede llegar a explicar el 0,66% de las variaciones fenotípicas de la NOA. Conclusión (es): Se realizó mapeo fino de la región de MHC y se identificaron dos zonas que de forma independiente son susceptibles de desarrollar NOA. Estos resultados aportan un entendimiento mayor sobre los mecanismos de asociación entre MHC y riesgo de NOA. [ABSTRACT FROM AUTHOR]