Characterization of a long terminal repeat region from an infectious Indian HIV type 2 isolate.

Tamhane, M ; Mukhopadhyaya, R

In: AIDS research and human retroviruses, Jg. 21 (2005-06-01), Heft 6, S. 592-6

academicJournal

An infectious Indian human immunodeficiency virus type 2 isolate from Mumbai, propagated in this laboratory, was found to bear an unusually short long terminal repeat (LTR) region. Complete sequencing of the 601 bp LTR indicated a loss of around 250 nucleotide pairs from the unique 3' (U3) region as compared to other well-characterized HIV-2 isolates. Phylogenetic analysis of this LTR shows closest relatedness to the Guinea-Bissau subtype A isolates HIV-2(CAM2) and HIV-2(ALI). The LTR from the biologically active infectious clone with the observed deletion contained all functionally relevant promoter and polyadenylation sequences.

Titel:	Characterization of a long terminal repeat region from an infectious Indian HIV type 2 isolate.
Autor/in / Beteiligte Person:	Tamhane, M ; Mukhopadhyaya, R
Zeitschrift:	AIDS research and human retroviruses, Jg. 21 (2005-06-01), Heft 6, S. 592-6
Veröffentlichung:	Larchmont, NY : Mary Ann Liebert ; <i>Original Publication</i>: [New York] : Mary Ann Liebert, [c1987-, 2005
Medientyp:	academicJournal
ISSN:	0889-2229 (print)
DOI:	10.1089/aid.2005.21.592
Schlagwort:	Base Sequence HIV-2 genetics Humans India Molecular Sequence Data Phylogeny Sequence Alignment Sequence Analysis, DNA HIV Infections virology HIV Long Terminal Repeat genetics HIV-2 pathogenicity
Sonstiges:	Nachgewiesen in: MEDLINE Sprachen: English Publication Type: Journal Article; Research Support, Non-U.S. Gov't Language: English [AIDS Res Hum Retroviruses] 2005 Jun; Vol. 21 (6), pp. 592-6. MeSH Terms: HIV Infections / virology ; HIV Long Terminal Repeat / genetics ; HIV-2 / *pathogenicity ; Base Sequence ; HIV-2 / genetics ; Humans ; India ; Molecular Sequence Data ; Phylogeny ; Sequence Alignment ; Sequence Analysis, DNA Molecular Sequence: GENBANK AY546083 Entry Date(s): Date Created: 20050702 Date Completed: 20050831 Latest Revision: 20061115 Update Code: 20231215

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