Quantification of Propionibacterium acidipropionici P169 bacteria in environmental samples by use of strain-specific primers derived by suppressive subtractive hybridization.

Peng, M ; Smith, AH ; et al.

In: Applied and environmental microbiology, Jg. 77 (2011-06-01), Heft 11, S. 3898-902

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A quantitative PCR (qPCR) assay targeting a gene identified by suppressive subtractive hybridization (SSH) was developed to detect Propionibacterium acidipropionici P169, with a threshold of 10(4) CFU/U of dairy feed or rumen fluid. The report is the first using a molecular marker generated by SSH to quantify a bacterial strain in environmental samples.

Titel:	Quantification of Propionibacterium acidipropionici P169 bacteria in environmental samples by use of strain-specific primers derived by suppressive subtractive hybridization.
Autor/in / Beteiligte Person:	Peng, M ; Smith, AH ; Rehberger, TG
Link:	Full Text Finder (Volltext)
Zeitschrift:	Applied and environmental microbiology, Jg. 77 (2011-06-01), Heft 11, S. 3898-902
Veröffentlichung:	Washington, American Society for Microbiology., 2011
Medientyp:	academicJournal
ISSN:	1098-5336 (electronic)
DOI:	10.1128/AEM.02586-10
Schlagwort:	Nucleic Acid Hybridization methods Propionibacterium genetics Sensitivity and Specificity Bacterial Load methods DNA Primers genetics DNA, Bacterial genetics Environmental Microbiology Polymerase Chain Reaction methods Propionibacterium isolation & purification
Sonstiges:	Nachgewiesen in: MEDLINE Sprachen: English Publication Type: Evaluation Study; Journal Article Language: English [Appl Environ Microbiol] 2011 Jun; Vol. 77 (11), pp. 3898-902. <i>Date of Electronic Publication: </i>2011 Apr 01. MeSH Terms: Environmental Microbiology* ; Bacterial Load / methods ; DNA Primers / genetics ; DNA, Bacterial / genetics ; Polymerase Chain Reaction / methods ; Propionibacterium / *isolation & purification ; Nucleic Acid Hybridization / methods ; Propionibacterium / genetics ; Sensitivity and Specificity References: Int J Food Microbiol. 2008 Aug 15;126(1-2):210-5. (PMID: 18573558) ; Int J Food Microbiol. 2006 Jul 1;110(1):69-76. (PMID: 16737755) ; J Dairy Sci. 2008 Feb;91(2):646-52. (PMID: 18218752) ; Proc Natl Acad Sci U S A. 1998 Oct 27;95(22):13108-13. (PMID: 9789049) ; J Microbiol Methods. 2006 Jan;64(1):46-62. (PMID: 16112762) ; Environ Microbiol. 2008 Oct;10(10):2842-56. (PMID: 18707609) ; Appl Environ Microbiol. 1998 Dec;64(12):4816-9. (PMID: 9835567) ; Annu Rev Genet. 1991;25:585-627. (PMID: 1812816) ; Syst Appl Microbiol. 2003 Jun;26(2):269-76. (PMID: 12866854) ; J Mol Biol. 1990 Oct 5;215(3):403-10. (PMID: 2231712) ; J Bacteriol. 2002 Aug;184(16):4475-88. (PMID: 12142418) ; J Microbiol Methods. 2007 Mar;68(3):588-95. (PMID: 17184861) ; Appl Environ Microbiol. 2007 Sep;73(17):5531-8. (PMID: 17630311) ; Can J Microbiol. 2000 Aug;46(8):736-40. (PMID: 10941520) ; J Appl Microbiol. 2004;97(1):38-47. (PMID: 15186440) ; J Dairy Sci. 2006 Jan;89(1):111-25. (PMID: 16357273) ; Appl Environ Microbiol. 1999 Sep;65(9):4241-4. (PMID: 10473444) ; FEMS Microbiol Lett. 2008 Mar;280(1):50-6. (PMID: 18179580) ; J Dairy Sci. 2002 Jul;85(7):1738-51. (PMID: 12201525) ; Int J Food Microbiol. 2001 Aug 15;68(1-2):45-52. (PMID: 11545219) ; Proc Natl Acad Sci U S A. 2001 Feb 27;98(5):2740-5. (PMID: 11226310) ; J Anim Physiol Anim Nutr (Berl). 2008 Apr;92(2):190-202. (PMID: 18336416) ; Int J Food Microbiol. 2003 Jul 25;84(2):189-96. (PMID: 12781941) ; J Bacteriol. 1972 Mar;109(3):1047-66. (PMID: 5062339) ; J Dairy Sci. 2003 Apr;86(4):1201-17. (PMID: 12741545) ; Appl Environ Microbiol. 2008 May;74(9):2679-89. (PMID: 18326671) ; Appl Environ Microbiol. 2006 Sep;72(9):6040-8. (PMID: 16957227) Substance Nomenclature: 0 (DNA Primers) ; 0 (DNA, Bacterial) Entry Date(s): Date Created: 20110405 Date Completed: 20110826 Latest Revision: 20211020 Update Code: 20231215 PubMed Central ID: PMC3127586

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