Population genetics of cucumber mosaic virus infecting medicinal, aromatic and ornamental plants from northern Italy.

Davino, S ; Panno, S ; et al.

In: Archives of virology, Jg. 157 (2012-04-01), Heft 4, S. 739-45

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The genetic variation and evolution of cucumber mosaic virus (CMV) from aromatic, medicinal and ornamental plants in northern Italy was studied by sequence analysis of the movement protein gene and comparison with equivalent sequences of isolates from other countries. Comparison of nonsynonymous and synonymous substitutions suggested that 30% of amino acid sites were under negative selection and only one was under positive selection. Phylogenetic, nucleotide diversity and genetic differentiation analyses suggested that long-distance migration plays a role in the evolution and determination of the genetic structure and diversity of CMV in northern Italy and other areas.

Titel:	Population genetics of cucumber mosaic virus infecting medicinal, aromatic and ornamental plants from northern Italy.
Autor/in / Beteiligte Person:	Davino, S ; Panno, S ; Rangel, EA ; Davino, M ; Bellardi, MG ; Rubio, L
Link:	View record at Springer (Volltext)
Zeitschrift:	Archives of virology, Jg. 157 (2012-04-01), Heft 4, S. 739-45
Veröffentlichung:	Wien, New York, Springer-Verlag., 2012
Medientyp:	academicJournal
ISSN:	1432-8798 (electronic)
DOI:	10.1007/s00705-011-1216-4
Schlagwort:	Amino Acid Substitution Cluster Analysis Cucumovirus isolation & purification Genetics, Population Italy Molecular Sequence Data Phylogeny Plant Viral Movement Proteins genetics Selection, Genetic Sequence Analysis, DNA Sequence Homology, Amino Acid Cucumovirus classification Cucumovirus genetics Genetic Variation Plants virology RNA, Viral genetics
Sonstiges:	Nachgewiesen in: MEDLINE Sprachen: English Publication Type: Journal Article Language: English [Arch Virol] 2012 Apr; Vol. 157 (4), pp. 739-45. <i>Date of Electronic Publication: </i>2012 Jan 05. MeSH Terms: Genetic Variation* ; Cucumovirus / classification ; Cucumovirus / genetics ; Plants / virology ; RNA, Viral / genetics ; Amino Acid Substitution ; Cluster Analysis ; Cucumovirus / isolation & purification ; Genetics, Population ; Italy ; Molecular Sequence Data ; Phylogeny ; Plant Viral Movement Proteins / genetics ; Selection, Genetic ; Sequence Analysis, DNA ; Sequence Homology, Amino Acid Molecular Sequence: GENBANK EU432178; EU432179; EU432180; EU432181; EU432182; EU432183; EU432184; JN593375; JN593376; JN593377; JN593378; JN593379; JN593380 Substance Nomenclature: 0 (Plant Viral Movement Proteins) ; 0 (RNA, Viral) Entry Date(s): Date Created: 20120106 Date Completed: 20120516 Latest Revision: 20120329 Update Code: 20231215

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