Einzeltreffer — DigiBib

We made a coupled genetic reporter that detects rare transcription misincorporation errors to measure RNA polymerase transcription fidelity in Escherichia coli Using this reporter, we demonstrated in vivo that the transcript cleavage factor GreA, but not GreB, is essential for proofreading of a transcription error where a riboA has been misincorporated instead of a riboG. A greA mutant strain had more than a 100-fold increase in transcription errors relative to wild-type or a greB mutant. However, overexpression of GreB in Δ greA cells reduced the misincorporation errors to wild-type levels, demonstrating that GreB at high concentration could substitute for GreA in RNA proofreading activity in vivo .

Titel:	A Cre Transcription Fidelity Reporter Identifies GreA as a Major RNA Proofreading Factor in Escherichia coli .
Autor/in / Beteiligte Person:	Bubunenko, MG ; Court, CB ; Rattray, AJ ; Gotte, DR ; Kireeva, ML ; Irizarry-Caro, JA ; Li, X ; Jin, DJ ; Court, DL ; Strathern, JN ; Kashlev, M
Link:	Full Text Finder (Volltext)
Zeitschrift:	Genetics, Jg. 206 (2017-05-01), Heft 1, S. 179-187
Veröffentlichung:	2021- : [Oxford] : Oxford University Press ; <i>Original Publication</i>: Austin, Tex. [etc.], 2017
Medientyp:	academicJournal
ISSN:	1943-2631 (electronic)
DOI:	10.1534/genetics.116.198960
Schlagwort:	DNA-Directed RNA Polymerases genetics Escherichia coli genetics Gene Expression Regulation, Bacterial Peptide Elongation Factors Promoter Regions, Genetic RNA biosynthesis RNA genetics Escherichia coli Proteins genetics Genes, Reporter genetics Transcription Factors genetics Transcription, Genetic Transcriptional Elongation Factors genetics
Sonstiges:	Nachgewiesen in: MEDLINE Sprachen: English Publication Type: Journal Article Language: English [Genetics] 2017 May; Vol. 206 (1), pp. 179-187. <i>Date of Electronic Publication: </i>2017 Mar 24. MeSH Terms: Transcription, Genetic* ; Escherichia coli Proteins / genetics ; Genes, Reporter / genetics ; Transcription Factors / genetics ; Transcriptional Elongation Factors / genetics ; DNA-Directed RNA Polymerases / genetics ; Escherichia coli / genetics ; Gene Expression Regulation, Bacterial ; Peptide Elongation Factors ; Promoter Regions, Genetic ; RNA / biosynthesis ; RNA / genetics References: Mol Cell. 2009 Jun 26;34(6):710-21. (PMID: 19560423) ; Nucleic Acids Res. 2015 Feb 18;43(3):1529-36. (PMID: 25605801) ; Genes Cells. 2003 Oct;8(10):779-88. (PMID: 14531857) ; Genesis. 2000 Feb;26(2):99-109. (PMID: 10686599) ; J Biol Chem. 2003 Sep 19;278(38):36905-15. (PMID: 12851389) ; EMBO J. 2003 Dec 1;22(23):6322-34. (PMID: 14633991) ; Curr Protoc Mol Biol. 2014 Apr 14;106:1.16.1-39. (PMID: 24733238) ; Cell. 1977 Jan;10(1):131-7. (PMID: 138485) ; Biochim Biophys Acta. 2002 Sep 13;1577(2):287-307. (PMID: 12213659) ; PLoS Genet. 2014 Sep 18;10(9):e1004532. (PMID: 25232834) ; EMBO J. 1983;2(8):1351-6. (PMID: 10872330) ; J Mol Biol. 2007 Mar 2;366(4):1243-57. (PMID: 17207814) ; J Biol Chem. 2009 Jul 17;284(29):19601-12. (PMID: 19439405) ; Proc Natl Acad Sci U S A. 2014 May 6;111(18):6642-7. (PMID: 24733897) ; EMBO J. 2000 Dec 15;19(24):6853-9. (PMID: 11118220) ; J Biol Chem. 2002 Jul 5;277(27):24420-6. (PMID: 12006589) ; J Mol Biol. 2008 Nov 7;383(2):367-79. (PMID: 18760284) ; Mol Cell. 2008 Jun 6;30(5):557-66. (PMID: 18538654) ; Genetics. 1987 Oct;117(2):173-9. (PMID: 2959588) ; Biomolecules. 2015 Jun 25;5(3):1195-209. (PMID: 26120903) ; Nature. 2012 Apr 25;484(7395):428. (PMID: 22538578) ; RNA. 2007 Jan;13(1):87-96. (PMID: 17095544) ; Biochimie. 1991 Dec;73(12):1517-23. (PMID: 1805967) ; Biochemistry. 1986 Oct 7;25(20):5920-8. (PMID: 3098280) ; Proc Natl Acad Sci U S A. 2013 Nov 12;110(46):18584-9. (PMID: 24167253) ; Mol Microbiol. 2005 Mar;55(5):1315-24. (PMID: 15720542) ; Biochim Biophys Acta. 2012 Jul;1819(7):694-9. (PMID: 22366339) ; Cell. 1998 May 15;93(4):627-37. (PMID: 9604937) ; Proc Natl Acad Sci U S A. 2003 Dec 23;100(26):15469-74. (PMID: 14668436) ; Nat Rev Mol Cell Biol. 2015 Nov;16(11):665-77. (PMID: 26397022) ; J Bacteriol. 2007 Apr;189(7):2844-53. (PMID: 17277072) ; J Biol Chem. 1998 Sep 4;273(36):22884-91. (PMID: 9722507) ; Nucleic Acids Res. 2015 Dec 2;43(21):10190-9. (PMID: 26304546) ; Annu Rev Genet. 2002;36:361-88. (PMID: 12429697) ; J Bacteriol. 2012 Jan;194(2):261-73. (PMID: 22056927) ; Cell. 1993 Feb 12;72(3):459-66. (PMID: 8431948) ; Mol Gen Genet. 1983;191(2):207-12. (PMID: 6353160) ; Nucleic Acids Res. 2003 Sep 15;31(18):5449-60. (PMID: 12954782) ; J Mol Biol. 1987 Jun 20;195(4):785-94. (PMID: 3656435) ; Nucleic Acids Res. 2010 Sep;38(17):5817-32. (PMID: 20462863) ; J Bacteriol. 1995 Jul;177(14):4121-30. (PMID: 7608087) ; Genome Biol. 2015 May 15;16:98. (PMID: 25976475) ; Methods Enzymol. 2013;533:79-102. (PMID: 24182919) ; Nucleic Acids Res. 2013 Dec;41(22):e204. (PMID: 24203710) ; Nucleic Acids Res. 2013 Oct;41(19):9090-104. (PMID: 23925128) ; J Biol Chem. 2007 Aug 17;282(33):24004-16. (PMID: 17573343) ; Mol Gen Genet. 1981;183(3):561-3. (PMID: 7038382) ; Methods Enzymol. 2013;533:157-77. (PMID: 24182922) ; Proc Natl Acad Sci U S A. 1995 Dec 5;92(25):11588-92. (PMID: 8524809) ; Science. 1993 Nov 5;262(5135):867-73. (PMID: 8235608) ; Nucleic Acids Res. 2017 Feb 17;45(3):1105-1113. (PMID: 28180286) ; Science. 2011 Jul 1;333(6038):53-8. (PMID: 21596952) ; J Bacteriol. 2007 Dec;189(24):8772-85. (PMID: 17766423) ; Science. 2012 Mar 16;335(6074):1302; author reply 1302. (PMID: 22422963) ; J Biol Chem. 1997 Mar 14;272(11):7201-10. (PMID: 9054416) ; Nature. 2011 Jan 20;469(7330):368-73. (PMID: 21248844) ; Science. 1997 Oct 3;278(5335):128-30. (PMID: 9311918) ; Cell. 2003 Aug 8;114(3):335-45. (PMID: 12914698) Contributed Indexing: Keywords: Cre/lox fidelity reporter; Gre proteins; RNA polymerase; transcription errors Substance Nomenclature: 0 (Escherichia coli Proteins) ; 0 (GreA protein, E coli) ; 0 (GreB protein, E coli) ; 0 (Peptide Elongation Factors) ; 0 (Transcription Factors) ; 0 (Transcriptional Elongation Factors) ; 63231-63-0 (RNA) ; EC 2.7.7.6 (DNA-Directed RNA Polymerases) Entry Date(s): Date Created: 20170326 Date Completed: 20170711 Latest Revision: 20201209 Update Code: 20240513 PubMed Central ID: PMC5419468

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A Cre Transcription Fidelity Reporter Identifies GreA as a Major RNA Proofreading Factor in Escherichia coli .