Einzeltreffer — DigiBib

Using site-specific mutagenesis, we constructed five more efficient variants of tRNA(Glu)-Suoc, an extremely inefficient ochre suppressor. Each variant has an extended anticodon, or region of the anticodon arm, which is more similar to that found in normal tRNAs which translate codons Uxx. Suppressor efficiency invariably increases with similarity of the extended anticodon to that of a normal Uxx-translating tRNA. Altered nucleotides in both helix and loop strongly affect efficiency, with no position dependence and no significant interaction between substitutions. The variant with all substitutions is 230-fold more efficient (in one context) than the parental tRNA(Glu)-Suoc. Two other unexpected variants seem to be 'context mutants', having altered response to message context.

Titel:	Systematic alterations in the anticodon arm make tRNA(Glu)-Suoc a more efficient suppressor.
Autor/in / Beteiligte Person:	Raftery, LA ; Yarus, M
Link:	Full Text Finder (Volltext)
Zeitschrift:	The EMBO journal, Jg. 6 (1987-05-01), Heft 5, S. 1499-506
Veröffentlichung:	2024- : [London] : Nature Publishing Group ; <i>Original Publication</i>: Eynsham, Oxford, England : Published for the European Molecular Biology Organization by IRL Press, [c1982-, 1987
Medientyp:	academicJournal
ISSN:	0261-4189 (print)
DOI:	10.1002/j.1460-2075.1987.tb02392.x
Schlagwort:	Base Sequence Glutamine genetics Mutation Nucleic Acid Conformation Anticodon Escherichia coli genetics Genes Genetic Variation RNA, Transfer genetics Suppression, Genetic
Sonstiges:	Nachgewiesen in: MEDLINE Sprachen: English Publication Type: Journal Article; Research Support, U.S. Gov't, P.H.S. Language: English [EMBO J] 1987 May; Vol. 6 (5), pp. 1499-506. MeSH Terms: RNA, Transfer* / genetics ; Anticodon ; Genes* ; Genetic Variation* ; Suppression, Genetic* ; Escherichia coli / *genetics ; Base Sequence ; Glutamine / genetics ; Mutation ; Nucleic Acid Conformation References: Virology. 1969 Sep;39(1):42-53. (PMID: 5807970) ; J Biol Chem. 1956 Jan;218(1):97-106. (PMID: 13278318) ; J Mol Biol. 1972 Aug 28;69(3):349-56. (PMID: 4562706) ; Nature. 1974 Jun 7;249(457):561-3. (PMID: 4599764) ; Proc Natl Acad Sci U S A. 1977 Dec;74(12):5463-7. (PMID: 271968) ; J Bacteriol. 1978 Jun;134(3):1141-56. (PMID: 149110) ; J Mol Biol. 1979 Jun 25;131(2):191-222. (PMID: 385890) ; Proc Natl Acad Sci U S A. 1979 Jul;76(7):3289-93. (PMID: 386336) ; Gene. 1980 Nov;11(3-4):207-18. (PMID: 6260570) ; J Mol Biol. 1980 Oct 25;143(2):161-78. (PMID: 6260957) ; Science. 1982 Nov 12;218(4573):646-52. (PMID: 6753149) ; Gene. 1982 Jul-Aug;19(1):43-54. (PMID: 6292048) ; Nucleic Acids Res. 1982 Oct 25;10(20):6487-500. (PMID: 6757864) ; Gene. 1982 Oct;19(3):269-76. (PMID: 6295880) ; J Mol Biol. 1983 Feb 15;164(1):59-71. (PMID: 6188840) ; Proc Natl Acad Sci U S A. 1983 Jul;80(13):3963-5. (PMID: 6575390) ; Mol Gen Genet. 1983;190(2):289-94. (PMID: 6410151) ; Methods Enzymol. 1983;101:20-78. (PMID: 6310323) ; Prog Nucleic Acid Res Mol Biol. 1983;30:41-90. (PMID: 6198694) ; J Bacteriol. 1984 Jun;158(3):849-59. (PMID: 6327642) ; Proc Natl Acad Sci U S A. 1985 Mar;82(6):1585-8. (PMID: 3856838) ; J Mol Biol. 1985 Jul 20;184(2):343-5. (PMID: 2863381) ; J Biol Chem. 1986 Apr 15;261(11):4868-74. (PMID: 3514605) ; Proc Natl Acad Sci U S A. 1986 Sep;83(17):6538-42. (PMID: 2428035) ; Virology. 1955 Jul;1(2):190-206. (PMID: 13267987) ; J Mol Biol. 1968 Jul 28;35(2):357-67. (PMID: 4939784) Grant Information: GM-30881 United States GM NIGMS NIH HHS Molecular Sequence: GENBANK X05359 Substance Nomenclature: 0 (Anticodon) ; 0RH81L854J (Glutamine) ; 9014-25-9 (RNA, Transfer) Entry Date(s): Date Created: 19870501 Date Completed: 19870831 Latest Revision: 20220511 Update Code: 20231215 PubMed Central ID: PMC553957

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Systematic alterations in the anticodon arm make tRNA(Glu)-Suoc a more efficient suppressor.