Einzeltreffer — DigiBib

In anaphase, any unresolved DNA entanglements between the segregating sister chromatids can give rise to chromatin bridges. To prevent genome instability, chromatin bridges must be resolved prior to cytokinesis. The SNF2 protein PICH has been proposed to play a direct role in this process through the remodeling of nucleosomes. However, direct evidence of nucleosome remodeling by PICH has remained elusive. Here, we present an in vitro single-molecule assay that mimics chromatin under tension, as is found in anaphase chromatin bridges. Applying a combination of dual-trap optical tweezers and fluorescence imaging of PICH and histones bound to a nucleosome-array construct, we show that PICH is a tension- and ATP-dependent nucleosome remodeler that facilitates nucleosome unwrapping and then subsequently slides remaining histones along the DNA. This work elucidates the role of PICH in chromatin-bridge dissolution, and might provide molecular insights into the mechanisms of related SNF2 proteins.

Titel:	PICH acts as a force-dependent nucleosome remodeler.
Autor/in / Beteiligte Person:	Spakman, D ; Clement, TVM ; Biebricher, AS ; King, GA ; Singh, MI ; Hickson, ID ; Peterman, EJG ; Wuite, GJL
Link:	View record at Springer (Volltext)
Zeitschrift:	Nature communications, Jg. 13 (2022-11-25), Heft 1, S. 7277
Veröffentlichung:	[London] : Nature Pub. Group, 2022
Medientyp:	academicJournal
ISSN:	2041-1723 (electronic)
DOI:	10.1038/s41467-022-35040-8
Schlagwort:	DNA Helicases metabolism Chromatin DNA metabolism Nucleosomes Histones genetics
Sonstiges:	Nachgewiesen in: MEDLINE Sprachen: English Publication Type: Journal Article; Research Support, Non-U.S. Gov't Language: English [Nat Commun] 2022 Nov 25; Vol. 13 (1), pp. 7277. <i>Date of Electronic Publication: </i>2022 Nov 25. MeSH Terms: Nucleosomes* ; Histones* / genetics ; DNA Helicases / metabolism ; Chromatin ; DNA / metabolism References: Nat Struct Mol Biol. 2019 Apr;26(4):267-274. (PMID: 30936532) ; Nat Struct Mol Biol. 2009 May;16(5):534-40. (PMID: 19377481) ; Annu Rev Biophys. 2021 May 6;50:73-93. (PMID: 33395550) ; Nucleic Acids Res. 2006;34(15):4160-7. (PMID: 16935875) ; Nucleic Acids Res. 2021 Mar 18;49(5):2418-2434. (PMID: 33590097) ; FEBS J. 2011 Oct;278(19):3619-32. (PMID: 21812931) ; ACS Cent Sci. 2016 Sep 28;2(9):660-666. (PMID: 27725965) ; Nucleic Acids Res. 2005 May 10;33(8):2676-84. (PMID: 15886396) ; Nucleic Acids Res. 2015 Apr 20;43(7):3578-90. (PMID: 25779043) ; Methods Mol Biol. 2018;1814:297-323. (PMID: 29956240) ; Nucleic Acids Res. 2011 Apr;39(8):3093-102. (PMID: 21177647) ; Curr Opin Genet Dev. 2014 Jun;26:1-5. (PMID: 24795279) ; Proc Natl Acad Sci U S A. 2002 Feb 19;99(4):1960-5. (PMID: 11854495) ; Biophys J. 2009 May 6;96(9):3708-15. (PMID: 19413976) ; Mol Cell. 2013 Sep 12;51(5):691-701. (PMID: 23973328) ; Nat Commun. 2020 Jan 8;11(1):126. (PMID: 31913285) ; Cell. 2007 Jan 12;128(1):101-14. (PMID: 17218258) ; J Biol Chem. 2005 May 20;280(20):19958-65. (PMID: 15772075) ; Nucleic Acids Res. 2019 Jan 25;47(2):666-678. (PMID: 30445475) ; Cell. 2015 Mar 12;160(6):1135-44. (PMID: 25768909) ; Proc Natl Acad Sci U S A. 2001 Jul 17;98(15):8454-60. (PMID: 11459989) ; EMBO J. 2007 Jul 25;26(14):3397-409. (PMID: 17599064) ; Biochim Biophys Acta. 2014 Aug;1839(8):728-36. (PMID: 24583555) ; Cold Spring Harb Symp Quant Biol. 2017;82:187-195. (PMID: 29167280) ; Signal Transduct Target Ther. 2020 Sep 15;5(1):204. (PMID: 32934203) ; J Biol Chem. 2005 Feb 11;280(6):4722-9. (PMID: 15548521) ; Biophys Chem. 2002 Dec 10;101-102:513-33. (PMID: 12488024) ; Am J Hum Genet. 2014 Feb 6;94(2):246-56. (PMID: 24507776) ; Proc Natl Acad Sci U S A. 2011 Feb 1;108(5):1885-90. (PMID: 21245354) ; Curr Pharm Biotechnol. 2009 Aug;10(5):474-85. (PMID: 19689315) ; Mol Cell Biol. 2000 Oct;20(20):7643-53. (PMID: 11003660) ; EMBO Rep. 2011 Sep 30;12(10):1032-8. (PMID: 21836640) ; EMBO J. 2011 Jul 08;30(16):3309-21. (PMID: 21743438) ; Mol Cell. 2006 Nov 17;24(4):559-68. (PMID: 17188033) ; Chromosoma. 2012 Aug;121(4):395-408. (PMID: 22527115) ; Proc Natl Acad Sci U S A. 2019 Mar 26;116(13):6120-6129. (PMID: 30867290) ; Proc Natl Acad Sci U S A. 2018 Jul 24;115(30):7777-7782. (PMID: 29987015) ; Cell Res. 2020 Sep;30(9):732-744. (PMID: 32355287) ; Sci Rep. 2020 Jun 18;10(1):9903. (PMID: 32555215) ; Proc Natl Acad Sci U S A. 2020 Oct 13;117(41):25486-25493. (PMID: 32989164) ; Phys Chem Chem Phys. 2011 Apr 28;13(16):7263-72. (PMID: 21416086) ; Nat Methods. 2007 Dec;4(12):1031-6. (PMID: 17994031) ; Cell Rep. 2015 Jan 13;10(2):216-25. (PMID: 25578730) ; J Cell Biol. 1983 Aug;97(2):542-8. (PMID: 6885908) ; Proc Natl Acad Sci U S A. 2006 Oct 24;103(43):15871-6. (PMID: 17043216) ; Trends Genet. 2013 Nov;29(11):621-9. (PMID: 23870137) ; Cell. 2020 Jun 11;181(6):1380-1394.e18. (PMID: 32502392) ; J Mol Biol. 1998 Feb 13;276(1):19-42. (PMID: 9514715) ; Mol Biol Cell. 2013 May;24(9):1375-86. (PMID: 23485565) ; Nucleic Acids Res. 2006 May 31;34(10):2887-905. (PMID: 16738128) ; Exp Cell Res. 1991 Nov;197(1):21-35. (PMID: 1915660) ; Cell. 2000 Dec 22;103(7):1133-42. (PMID: 11163188) ; EMBO J. 2011 May 06;30(12):2364-72. (PMID: 21552204) ; Chem Rev. 2014 Mar 26;114(6):3087-119. (PMID: 24443844) ; Nat Commun. 2015 Dec 08;6:8962. (PMID: 26643143) ; Nature. 1997 Sep 18;389(6648):251-60. (PMID: 9305837) ; J Biol Chem. 2017 Oct 20;292(42):17506-17513. (PMID: 28855255) ; EMBO J. 2002 Sep 16;21(18):4749-53. (PMID: 12234915) ; PLoS One. 2012;7(4):e33905. (PMID: 22563370) ; Cell Res. 2011 Mar;21(3):396-420. (PMID: 21358755) ; Trends Biochem Sci. 2005 Dec;30(12):680-7. (PMID: 16257529) ; Nature. 2009 Feb 5;457(7230):745-8. (PMID: 19060884) ; Anal Biochem. 2007 Sep 15;368(2):193-204. (PMID: 17553453) ; Methods Enzymol. 2012;513:3-28. (PMID: 22929763) ; Nat Struct Mol Biol. 2018 Sep;25(9):868-876. (PMID: 30177760) ; Trends Biochem Sci. 2020 Jan;45(1):13-26. (PMID: 31630896) ; J Mol Biol. 2012 Nov 9;423(5):687-701. (PMID: 22944905) ; Nature. 2006 Aug 10;442(7103):709-12. (PMID: 16799566) Substance Nomenclature: 0 (Nucleosomes) ; 0 (Histones) ; EC 3.6.4.- (DNA Helicases) ; 0 (Chromatin) ; 9007-49-2 (DNA) Entry Date(s): Date Created: 20221126 Date Completed: 20221129 Latest Revision: 20221228 Update Code: 20231215 PubMed Central ID: PMC9700735

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