Hundreds of variants clustered in genomic loci and biological pathways affect human height
In: Nature, Jg. 467 (2010-09-29), S. 832-838
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Most common human traits and diseases have a polygenic pattern of inheritance: DNA sequence variants at many genetic loci influence the phenotype. Genome-wide association (GWA) studies have identified more than 600 variants associated with human traits1, but these typically explain small fractions of phenotypic variation, raising questions about the use of further studies. Here, using 183,727 individuals, we show that hundreds of genetic variants, in at least 180 loci, influence adult height, a highly heritable and classic polygenic trait2,3. The large number of loci reveals patterns with important implications for genetic studies of common human diseases and traits. First, the 180 loci are not random, but instead are enriched for genes that are connected in biological pathways ( P=0.016) and that underlie skeletal growth defects ( P
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Hundreds of variants clustered in genomic loci and biological pathways affect human height
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| Autor/in / Beteiligte Person: | Gudnason, Vilmundur ; Weyant, Robert J. ; Kaplan, Robert C. ; O'Connell, Jeffrey R. ; Deloukas, Panos ; McKnight, Barbara ; Alessandro De Grandi ; Gert-Jan B. van Ommen ; Boerwinkle, Eric ; Liang, Liming ; Levinson, Douglas F. ; Hayes, Richard B. ; McCarthy, Mark I. ; Morris, Andrew P. ; Hirschhorn, Joel N. ; Kaprio, Jaakko ; Samani, Nilesh J. ; König, Inke R. ; Hu, Frank B. ; Wareham, Nicholas J. ; Polasek, Ozren ; Turchin, Michael C. ; Gudbjartsson, Daniel F. ; Igl, Wilmar ; Mooser, Vincent ; Havulinna, Aki S. ; Assimes, Themistocles L. ; Palmer, Cameron D. ; Coin, Lachlan J. M. ; Albrecht, Eva ; Hana Lango Allen ; Barroso, Inês ; Eco J. C. de Geus ; Wichmann, H.-Erich ; Province, Michael A. ; Wild, Sarah H. ; Munroe, Patricia B. ; Erdmann, Jeanette ; Lorentzon, Mattias ; Preuss, Michael ; Freimer, Nelson B. ; Kähönen, Mika ; Bhangale, Tushar ; Glazer, Nicole L. ; Nieminen, Markku S. ; Hicks, Andrew A. ; Tyrer, Jonathan ; Montgomery, Grant W. ; Loos, Ruth J. F. ; Purcell, Shaun ; Kayser, Manfred ; Järvelin, Marjo-Riitta ; Paré, Guillaume ; Lehtimäki, Terho ; Pichler, Irene ; Surakka, Ida ; Esko, Tõnu ; Kraft, Peter ; Haritunians, Talin ; Sinisalo, Juha ; Nelis, Mari ; Vitart, Veronique ; Sanders, Alan R. ; Hall, Alistair S. ; Iribarren, Carlos ; Cooper, Mark E. ; Uitterlinden, André G. ; Kovacs, Peter ; Schlessinger, David ; Ernst, Florian ; Lokki, Marja-Liisa ; M. Juhani Junttila ; Ridderstråle, Martin ; Viikari, Jorma ; Prokopenko, Inga ; O'Donnell, Christopher J. ; Hui, Jennie ; Rissanen, Aila ; Abecasis, Gonçalo R. ; Hottenga, Jouke-Jan ; Pastinen, Tomi ; Jacobs, Kevin B. ; Smit, Jan ; Ardlie, Kristin G. ; Pellikka, Niina ; Robertson, Neil R. ; Müller, Martina ; Peden, John F. ; Feitosa, Mary F. ; Winkler, Thomas W. ; Stefansson, Kari ; Liu, Jianjun ; Laitinen, Jaana ; Haiqing, Shen ; Farrall, Martin ; Chatterjee, Nilanjan ; Wheeler, Eleanor ; Harris, Tamara B. ; Johansson, Åsa ; Hamsten, Anders ; Speliotes, Elizabeth K. ; Atwood, Larry D. ; Steinthorsdottir, Valgerdur ; Grundberg, Elin ; Soranzo, Nicole ; Hartikainen, Anna-Liisa ; Absher, Devin ; Lindgren, Cecilia M. ; Salem, Rany M. ; Citterio, Lorena ; Estrada, Karol ; Bergmann, Sven ; Kwan, Tony ; Meitinger, Thomas ; Wright, Alan F. ; Bergman, Richard N. ; Vedantam, Sailaja ; Pietiläinen, Kirsi H. ; Zgaga, Lina ; Jackson, Anne U. ; Schreiber, Stefan ; Park, Ju-Hyun ; Glorioso, Nicola ; Shi, Jianxin ; Amin, Najaf ; Nyholt, Dale R. ; Launer, Lenore J. ; Schunkert, Heribert ; Quertermous, Thomas ; Mari Liis Tammesoo ; Boomsma, Dorret I. ; Campbell, Harry ; Smith, Albert V. ; Wood, Andrew R. ; Fox, Caroline S. ; Zitting, Paavo ; Boucher, Gabrielle ; Parker, Alex N. ; Sambrook, Jennifer G. ; Joyce B. J. van Meurs ; Stringham, Heather M. ; Peters, Marjolein J. ; Kathiresan, Sekar ; Widen, Elisabeth ; Hayward, Caroline ; Spector, Tim D. ; Waterworth, Dawn M. ; Rivolta, Carlo ; Jula, Antti ; Hofman, Albert ; Watkins, Hugh ; McArdle, Wendy L. ; Elosua, Roberto ; Koiranen, Markku ; Ridker, Paul M. ; Heid, Iris M. ; Kaplan, Lee M. ; Brenda W.J.H. Penninx ; Visscher, Peter M. ; Ohlsson, Claes ; Hall, Per ; Voight, Benjamin F. ; Oostra, Ben A. ; Dominiczak, Anna F. ; Martin den Heijer ; Maschio, Andrea ; Gibson, Quince ; Pramstaller, Peter P. ; Rayner, Nigel W. ; Carsten Oliver Schmidt ; Johnson, Toby ; Grönberg, Henrik ; M. Carola Zillikens ; Shuldiner, Alan R. ; Cornelia M. van Duijn ; Ripatti, Samuli ; Ingelsson, Erik ; Thompson, John R. ; Chanock, Stephen J. ; Kettunen, Johannes ; Hunter, David J. ; Palmer, Lyle J. ; Gyllensten, Ulf ; Xu, Jianfeng ; Petersmann, Astrid ; Eriksson, Johan G. ; Lettre, Guillaume ; Ferreira, Teresa ; Wiklund, Fredrik ; Ziegler, Andreas ; Metspalu, Andres ; Rotter, Jerome I. ; Rafelt, Suzanne ; Ngwa, Julius S. ; Collins, Francis S. ; Weedon, Michael N. ; Illig, Thomas ; Hoffman, Wolfgang ; Heard-Costa, Nancy L. ; Tönjes, Anke ; Chasman, Daniel I. ; Arnold, Alice M. ; Raitakari, Olli T. ; Dixon, Anna L. ; Qi, Lu ; Goddard, Michael E. ; Pouta, Anneli ; Caulfield, Mark J. ; Vandenput, Liesbeth ; Gieger, Christian ; L. Adrienne Cupples ; Salomaa, Veikko ; Altmaier, Elizabeth L. ; Martin, Nicholas G. ; Kocher, Thomas D. ; Duan, Jubao ; Siscovick, David S. ; Huikuri, Heikki V. ; Ouwehand, Willem H. ; North, Kari E. ; Hengstenberg, Christian ; Beckmann, Jacques S. ; Chen, Constance ; Perry, John ; Marušić, Ana ; Melander, Olle ; Rioux, John D. ; Salvi, Erika ; Hattersley, Andrew T. ; Elliott, Paul ; Groop, Leif ; Willer, Cristen J. ; Uda, Manuela ; Thorleifsson, Gudmar ; Schadt, Eric E. ; White, Charles C. ; Gejman, Pablo V. ; Sanna, Serena ; Sovio, Ulla ; Lawrence, Robert W. ; Thorsteinsdottir, Unnur ; Segrè, Ayellet V. ; Cusi, Daniele ; G. Bragi Walters ; Ken Sin Lo ; Kolcic, Ivana ; Rudan, Igor ; Berndt, Sonja I. ; Monda, Keri L. ; Raychaudhuri, Soumya ; Luan, Jian'an ; Randall, Joshua C. ; Balmforth, Anthony J. ; Aulchenko, Yurii S. ; Almgren, Peter ; Mohlke, Karen L. ; Frayling, Timothy M. ; Ketkar, Shamika ; Mosley, Thomas H. ; Perola, Markus ; Völzke, Henry ; Zagato, Laura ; Peltonen, Leena ; Koskinen, Seppo ; Mangino, Massimo ; Hao, Ke ; Workalemahu, Tsegaselassie ; Kiemeney, Lambertus A. ; Alavere, Helene ; Tuomilehto, Jaakko ; Mägi, Reedik ; Wilson, James F. ; Borecki, Ingrid B. ; Kutalik, Zoltán ; Stumvoll, Michael ; Verlaan, Dominique J. ; Musk, Arthur W. ; Kajantie, Eero ; Yang, Jian ; Knowles, Joshua W. ; Kilpeläinen, Tuomas O. ; Boehnke, Michael ; G. Mark Lathrop ; Beilby, John ; Rivadeneira, Fernando ; Eiriksdottir, Gudny ; Willemsen, Gonneke ; Heath, Andrew C. ; Mulas, Antonella ; Katja K.H. Aben ; Strachan, David P. ; Aspelund, Thor ; Jing Hua Zhao ; Psychiatry ; NCA - Anxiety & Depression ; EMGO - Mental health ; Medicine, Internal ; Epidemiology ; Care, Intensive ; Genetics, Clinical ; Identification, Genetic ; Medical Research Council (MRC) ; Psychology, Biological ; Neuroscience Campus Amsterdam - Anxiety & Depression ; EMGO+ - Mental Health ; Genetics of Complex Traits ; University of Exeter ; Department of Epidemiology ; Erasmus Medical Centre ; Netherlands Genomics Initiative (NGI) ; Netherlands Genomics Initiative ; Department of Medicine, Montreal ; National Cancer Institute [Bethesda] (NCI-NIH) ; National Institutes of Health [Bethesda] (NIH) ; Department of Biostatistics ; University of Michigan [Ann Arbor] ; University of Michigan System-University of Michigan System ; Genetics, deCODE ; deCODE genetics [Reykjavik] ; Divisions of Genetics and Endocrinology and Program in Genomics ; Boston Children's Hospital ; Metabolism Initiative and Program in Medical and Population Genetics ; Broad Institute of MIT and Harvard (BROAD INSTITUTE) ; Harvard Medical School [Boston] (HMS)-Massachusetts Institute of Technology (MIT)-Massachusetts General Hospital [Boston]-Harvard Medical School [Boston] (HMS)-Massachusetts Institute of Technology (MIT)-Massachusetts General Hospital [Boston] ; Institut de Génomique d'Evry (IG) ; Institut de Biologie François JACOB (JACOB) ; Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)) ; Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)) ; Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay ; the Genetic Investigation of ANthropocentric Traits (GIANT) Consortium ; Université Paris-Saclay-Institut de Biologie François JACOB (JACOB) ; Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA) |
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| Zeitschrift: | Nature, Jg. 467 (2010-09-29), S. 832-838 |
| Veröffentlichung: | Springer Science and Business Media LLC, 2010 |
| Medientyp: | unknown |
| ISSN: | 1476-4687 (print) ; 0028-0836 (print) ; 1476-4679 (print) |
| DOI: | 10.1038/nature09410 |
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