Analysis of a ribosomal RNA operon in the actinomycete Frankia

Nazaret, Sylvie ; Cournoyer, Benoit ; et al.

In: Gene, Jg. 111 (1992-02-01), Heft 1

Online unknown

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The organisation of ribosomal RNA-encoding (rrn) genes has been studied in Frankia sp. strain ORS020606. The two rrn clusters present in Frankia strain ORS020606 were isolated from genomic banks in phage lambda EMBL3 by hybridization with oligodeoxyribonucleotide probes. The 5'-3' gene order is the usual one for bacteria: 16S-23S-5S. The two clusters are not distinguishable by restriction enzyme mapping inside the coding section, but vary considerably outside it. Sequencing showed that the 16S-rRNA-encoding gene of ORS020606 is very closely related to that of another Alnus-infective Frankia strain (Ag45/Mut15) and highly homologous to corresponding genes of Streptomyces spp. Two possible promoter sequences were detected upstream from the 16S gene, while no tRNA-encoding gene was detected in the whole operon. Regions with a high proportion of divergence for the study of phylogenetic relationships within the genus were looked for and found in the first intergenic spacer, in the 23S and in the 16S gene.

Titel:	Analysis of a ribosomal RNA operon in the actinomycete Frankia
Autor/in / Beteiligte Person:	Nazaret, Sylvie ; Cournoyer, Benoit ; Simonet, Pascal ; Normand, Philippe
Link:	View record in OpenAIRE (Volltext) E-Journal im Bestand der UB Hagen? https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/1372279
Zeitschrift:	Gene, Jg. 111 (1992-02-01), Heft 1
Veröffentlichung:	1992
Medientyp:	unknown
ISSN:	0378-1119 (print)
Schlagwort:	Genetics DNA, Bacterial biology Base Sequence Operon Frankia Molecular Sequence Data Restriction Mapping General Medicine Ribosomal RNA biology.organism_classification 16S ribosomal RNA Molecular biology Homology (biology) RNA, Bacterial Restriction map RNA, Ribosomal Multigene Family Actinomycetales Ribosomal DNA Gene
Sonstiges:	Nachgewiesen in: OpenAIRE Rights: CLOSED

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