Characterization of a Long Terminal Repeat Region from an Infectious Indian HIV Type 2 Isolate

Tamhane, Mayur C. ; Mukhopadhyaya, Rita ; et al.

In: AIDS Research and Human Retroviruses, Jg. 21 (2005-06-01), S. 592-596

Online unknown

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An infectious Indian human immunodeficiency virus type 2 isolate from Mumbai, propagated in this laboratory, was found to bear an unusually short long terminal repeat (LTR) region. Complete sequencing of the 601 bp LTR indicated a loss of around 250 nucleotide pairs from the unique 3' (U3) region as compared to other well-characterized HIV-2 isolates. Phylogenetic analysis of this LTR shows closest relatedness to the Guinea-Bissau subtype A isolates HIV-2(CAM2) and HIV-2(ALI). The LTR from the biologically active infectious clone with the observed deletion contained all functionally relevant promoter and polyadenylation sequences.

Titel:	Characterization of a Long Terminal Repeat Region from an Infectious Indian HIV Type 2 Isolate
Autor/in / Beteiligte Person:	Tamhane, Mayur C. ; Mukhopadhyaya, Rita ; Mukhopadhyaya, Robin
Link:	View record in OpenAIRE (Volltext) https://doi.org/10.1089/aid.2005.21.592
Zeitschrift:	AIDS Research and Human Retroviruses, Jg. 21 (2005-06-01), S. 592-596
Veröffentlichung:	Mary Ann Liebert Inc, 2005
Medientyp:	unknown
ISSN:	1931-8405 (print) ; 0889-2229 (print)
DOI:	10.1089/aid.2005.21.592
Schlagwort:	clone (Java method) Polyadenylation Base pair viruses Molecular Sequence Data Immunology Human immunodeficiency virus (HIV) India HIV Infections medicine.disease_cause Virus Virology medicine Humans Phylogeny HIV Long Terminal Repeat Genetics Base Sequence biology Phylogenetic tree Sequence Analysis, DNA biology.organism_classification Long terminal repeat Infectious Diseases HIV-2 Lentivirus Sequence Alignment
Sonstiges:	Nachgewiesen in: OpenAIRE

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