Codon usage inCryptosporidium parvumdiffers from that in other Eimeriorina

Farthing, Mjg ; Char, S. ; et al.

In: Parasitology, Jg. 112 (1996-04-01), S. 357-362

Online unknown

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SUMMARYCodon usage ofCrytosporidium parvumwas compared with those of other EimeriorinaToxoplasma gondiiandEimeria tenellaand revealed a biased use of synonymous codons with a preference for NNU (40·0%) and NNA (33·4%). There was no close resemblance of the codon usage ofC. parvumtoT. gondii(correlation coefficient, r = 0·14) orE. tenella(r = 0·14) but it was similar toEntamoeba histolytica(r = 0·75) andPlasmodium falciparum(r = 0·5). Analysis of the codon usage in homologous gene sequences (actin, β-tubulin) also failed to reveal a close relationship betweenC. parvumandT. gondiiorE. tenella. The low usage codons inC. parvumwere most frequently used codons inT. gondiiandE. tenella. These observations are consistent with 18S rRNA sequence analysis which shows no close relationship ofCryptosporidiumwith other Eimeriorina (Sarcocystis, ToxoplasmaandEimeria) and questions the validity of the current classification ofC. parvum.

Titel:	Codon usage inCryptosporidium parvumdiffers from that in other Eimeriorina
Autor/in / Beteiligte Person:	Farthing, Mjg ; Char, S. ; Naeem, A. ; Kelly, Paul
Link:	View record in OpenAIRE (Volltext) https://doi.org/10.1017/s0031182000066580
Zeitschrift:	Parasitology, Jg. 112 (1996-04-01), S. 357-362
Veröffentlichung:	Cambridge University Press (CUP), 1996
Medientyp:	unknown
ISSN:	1469-8161 (print) ; 0031-1820 (print)
DOI:	10.1017/s0031182000066580
Schlagwort:	Sequence analysis Protozoan Proteins Cryptosporidium Eimeria Entamoeba histolytica Eimeriorina Tubulin Animals Codon Genetics biology Toxoplasma gondii biology.organism_classification Virology Actins Coccidia Infectious Diseases Cryptosporidium parvum RNA, Ribosomal Codon usage bias Sarcocystis Animal Science and Zoology Parasitology Toxoplasma Eimeria tenella RNA, Protozoan
Sonstiges:	Nachgewiesen in: OpenAIRE Rights: CLOSED

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