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Whole exome sequencing, in silico and functional studies confirm the association of the GJB2 mutation p.Cys169Tyr with deafness and suggest a role for the TMEM59 gene in the hearing process

Mahfood, Mona ; Harati, Rania ; et al.
In: Saudi Journal of Biological Sciences Saudi Journal of Biological Sciences, Jg. 28 (2021), Heft 8, S. 4421-4429
Online unknown

Titel:
Whole exome sequencing, in silico and functional studies confirm the association of the GJB2 mutation p.Cys169Tyr with deafness and suggest a role for the TMEM59 gene in the hearing process
Autor/in / Beteiligte Person: Mahfood, Mona ; Harati, Rania ; Chouchen, Jihen ; Abdullah Al Mutery ; Walaa Kamal Eddine Ahmad Mohamed ; Tlili, Abdelaziz
Link:
Zeitschrift: Saudi Journal of Biological Sciences Saudi Journal of Biological Sciences, Jg. 28 (2021), Heft 8, S. 4421-4429
Veröffentlichung: Elsevier, 2021
Medientyp: unknown
ISSN: 2213-7106 (print) ; 1319-562X (print)
Schlagwort:
  • 0106 biological sciences
  • 0301 basic medicine
  • RFLP, restriction fragment length polymorphism
  • SAM, Sequence Alignment/Map
  • BWA, Burrows-Wheeler Aligner
  • 01 natural sciences
  • ARNSHL, autosomal recessive non-syndromic hearing loss
  • Non-syndromic hearing loss
  • NSHL, Non-syndromic hearing loss
  • Missense mutation
  • BAM, Binary Alignment Map
  • VariMAT, Variation and Mutation Annotation Toolkit
  • Biology (General)
  • RT-qPCR, quantitative reverse transcription PCR
  • Exome sequencing
  • KCNQ3, Potassium Voltage-Gated Channel Subfamily Q Member 3
  • Genetics
  • WES, Whole exome sequencing
  • ST3GAL1, ST3 Beta-Galactoside Alpha-2,3-Sialyltransferase 1
  • Mutation (genetic algorithm)
  • gnomAD, genome aggregation database
  • Original Article
  • medicine.symptom
  • General Agricultural and Biological Sciences
  • GJB2, Gap Junction Protein Beta 2
  • gEAR, gene Expression Analysis Resource
  • Hearing loss
  • QH301-705.5
  • In silico
  • Biology
  • SJL, Swiss Jim Lambert
  • DNA sequencing
  • SPATA13, Spermatogenesis Associated 13
  • HL, Hearing loss
  • 03 medical and health sciences
  • PROVEAN, Protein Variation Effect Analyzer
  • UAE, United Arab Emirates
  • medicine
  • otorhinolaryngologic diseases
  • dpSNP, Single Nucleotide Polymorphism Database
  • Gene
  • Genetic heterogeneity
  • C1QTNF9, C1q and TNF related 9
  • Whole exome sequencing
  • SIFT, Sorting Intolerant From Tolerant
  • NGS, next generation sequencing
  • PolyPhen-2, Polymorphism Phenotyping v2
  • TMEM59, Transmembrane Protein 59
  • RT-PCR, reverse transcription PCR
  • 030104 developmental biology
  • HHLA1, HERV-H LTR-Associating 1
  • Cx26, Connexin 26
  • qPCR, quantitative PCR
  • ESRRAP2, Estrogen-Related Receptor Alpha Pseudogene 2
  • ROH, runs of homozygosity
  • 010606 plant biology & botany
  • GJB2 gene
  • Actb, Actin beta
Sonstiges:
  • Nachgewiesen in: OpenAIRE
  • Sprachen: English
  • Language: English
  • Rights: OPEN

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