Sequenciamento genômico parcial de um isolado atípico do Lettuce mosaic virus (LMV) ; Partial sequencing of an atypical isolate of the Lettuce mosaic virus (LMV)

Dissertação apresentada a Universidade Federal de Lavras, como parte das exigências do Programa de Pós Graduação em Agronomia/Fitopatologia para a obtenção do título de Mestre. ; Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) ; Fitopatologia ; As doenças de etiologia viral são consideradas como um dos maiores problemas fitossanitários da cultura da alface, onde o Lettuce mosaic virus (LMV) tem sido o mais importante entre os vírus que ocorrem no Brasil. Nesse trabalho, um isolado de LMV, denominado de LMV-Cf, que causa sintomas atípicos, caracterizados por um fechamento da cabeça da alface cv. Regina 579, o que não ocorre quando essa está infectada com outros isolados desse vírus, foi parcialmente sequenciado e analisado, com a finalidade de investigar possíveis segmentos genômicos ligados a esse sintoma. Foram desenhados primers com base nas sequencias disponíveis no GenBank e as sequencias obtidas por RT-PCR foram analisadas e comparadas com outros isolados de LMV. Uma alteração significativa foi encontrada na proteína P3 do LMV-Cf, que apresentou a deleção de três nucleotídeos na região 3’, resultando na exclusão de um aminoácido, o ácido glutâmico, na região C-terminal da proteína. Sendo assim, mesmo tendo mostrado identidades de nucleotídeos entre 93 e 97%, que representa a mesma variabilidade observada entre os demais isolados do GenBank, a identidade de aminoácidos foi menor, entre 92 e 95%, o que o separou desses isolados na árvore filogenética. Outra proteína que apresentou uma diferença marcante foi a 6K2. A identidade de aminoácidos dessa proteína, entre os isolados já sequenciados do GenBank, foi de 100%, sendo, portanto, a mais conservada, enquanto que a identidade de aminoácidos entre o LMV-Cf e esses isolados foi de 92%. Como existem evidências de que tanto a P3 como a 6K2 estão ligadas à expressão de sintomas nas plantas hospedeiras, elas foram consideradas candidatas a serem investigadas com a finalidade de se determinar se essas diferenças, em sua composição de ...