A phylogenetic tree built using RaxML [78] with the BINCAT model and treating each isolate’s binary presence/absence vector as a binary sequence.

Gerry Tonkin-Hill (8327550) ; Shazia Ruybal-Pesántez (6871271) ; et al.

2021

Bild

The population structure evident in the t-SNE plot is reproduced in this analysis. Peru is split into two populations and Ghana is more distinct from Uganda than the FFP and Admixture analysis. Colombia is found to be closer to the other South American isolates in this analysis. (TIF)

Titel:	A phylogenetic tree built using RaxML [78] with the BINCAT model and treating each isolate’s binary presence/absence vector as a binary sequence.
Autor/in / Beteiligte Person:	Gerry Tonkin-Hill (8327550) ; Shazia Ruybal-Pesántez (6871271) ; Kathryn E. Tiedje (10196122) ; Virginie Rougeron (191120) ; Michael F. Duffy (10196125) ; Sedigheh Zakeri (84911) ; Tepanata Pumpaibool (8551125) ; Pongchai Harnyuttanakorn (3482726) ; OraLee H. Branch (10196128) ; Lastenia Ruiz-Mesía (3060711) ; Thomas S. Rask (10196131) ; Franck Prugnolle (21227) ; Anthony T. Papenfuss (9450362) ; Yao-ban Chan (10196134) ; Karen P. Day (9678099)
Link:	https://figshare.com/articles/figure/A_phylogenetic_tree_built_using_RaxML_78_with_the_BINCAT_model_and_treating_each_isolate_s_binary_presence_absence_vector_as_a_binary_sequence_/14115892 https://doi.org/10.1371/journal.pgen.1009269.s009
Veröffentlichung:	2021
Medientyp:	Bild
DOI:	10.1371/journal.pgen.1009269.s009
Schlagwort:	Microbiology Cell Biology Genetics Evolutionary Biology Ecology Infectious Diseases Environmental Sciences not elsewhere classified Biological Sciences not elsewhere classified variant surface antigen population structure surface antigen variants PfEMP 1 DBL α domain DBL α type diversity var genes encoding encodes PfEMP 1 var multigene family malaria parasite Plasmodium falciparum Plasmodium Laverania species immunodominant surface antigens DBL α types variant surface antigen-encoding genes HIV surveillance
Sonstiges:	Nachgewiesen in: BASE Sprachen: unknown Collection: Smithsonian Institution: Digital Repository Document Type: still image Language: unknown Rights: CC BY 4.0

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