Einzeltreffer — DigiBib

The total number of sequence reads were computationally down-sampled from 15M down to 10K by increments of 5M reads, for each set of samples (a- S1, b- S2, c- S3, d- S4), prior to and following OmniCleave or 0.45μm filter. % coverage: proportion of positions sequenced out of MeV complete genome; avg. depth: average number of repeats in each position of MeV complete genome.

Titel:	Effect of in-silico down-sampling on MeV genome coverage and depth.
Autor/in / Beteiligte Person:	Efrat Bucris (10475405) ; Victoria Indenbaum (9673992) ; Roberto Azar (11419383) ; Oran Erster (10475408) ; Eric Haas (11419386) ; Ella Mendelson (67573) ; Neta S. Zuckerman (10475402)
Link:	https://figshare.com/articles/figure/Effect_of_in-silico_down-sampling_on_MeV_genome_coverage_and_depth_/16604586 https://doi.org/10.1371/journal.pone.0255663.g003
Veröffentlichung:	2021
Medientyp:	Bild
DOI:	10.1371/journal.pone.0255663.g003
Schlagwort:	Microbiology Cell Biology Genetics Biotechnology Evolutionary Biology Ecology Cancer Inorganic Chemistry Infectious Diseases Virology Biological Sciences not elsewhere classified low evolutionary rates 5 million sequences 15 million sequences 10 &# 8211 1 &# 8211 x50 average depth mev genome coverage medium mev quantities lower mev quantities positive samples demonstrated patient urine samples approach enables real mev using filtration sequencing depth assessed using treated mev mev content numerous samples sequence reads
Sonstiges:	Nachgewiesen in: BASE Sprachen: unknown Collection: Smithsonian Institution: Digital Repository Document Type: still image Language: unknown Rights: CC BY 4.0

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Effect of in-silico down-sampling on MeV genome coverage and depth.