Transcriptomic and genomic heterogeneity in blastic plasmacytoid dendritic cell neoplasms: from ontogeny to oncogenesis
In: ISSN: 2473-9529, 2021
academicJournal
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Oncogenesis and ontogeny of blastic plasmacytoid dendritic cell neoplasm (BPDCN) remain uncertain, between canonical plasmacytoid dendritic cells (pDCs) and AXL+ SIGLEC6+ DCs (AS-DCs). We compared 12 BPDCN to 164 acute leukemia by Affymetrix HG-U133 Plus 2.0 arrays: BPDCN were closer to B-cell acute lymphoblastic leukemia (ALL), with enrichment in pDC, B-cell signatures, vesicular transport, deubiquitination pathways, and AS-DC signatures, but only in some cases. Importantly, 1 T-cell ALL clustered with BPDCN, with compatible morphology, immunophenotype (cCD3+ sCD3− CD123+ cTCL1+ CD304+), and genetics. Many oncogenetic pathways are deregulated in BPDCN compared with normal pDC, such as cell-cycle kinases, and importantly, the transcription factor SOX4, involved in B ontogeny, pDC ontogeny, and cancer cell invasion. High-throughput sequencing (HaloPlex) showed myeloid mutations (TET2, 62%; ASXL1, 46%; ZRSR2, 31%) associated with lymphoid mutations (IKZF1), whereas single-nucleotide polymorphism (SNP) array (Affymetrix SNP array 6.0) revealed frequent losses (mean: 9 per patient) involving key hematological oncogenes (RB1, IKZF1/2/3, ETV6, NR3C1, CDKN2A/B, TP53) and immune response genes (IFNGR, TGFB, CLEC4C, IFNA cluster). Various markers suggest an AS-DC origin, but not in all patients, and some of these abnormalities are related to the leukemogenesis process, such as the 9p deletion, leading to decreased expression of genes encoding type I interferons. In addition, the AS-DC profile is only found in a subgroup of patients. Overall, the cellular ontogenic origin of BPDCN remains to be characterized, and these results highlight the heterogeneity of BPDCN, with a risk of a diagnostic trap.
| Titel: |
Transcriptomic and genomic heterogeneity in blastic plasmacytoid dendritic cell neoplasms: from ontogeny to oncogenesis
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| Autor/in / Beteiligte Person: | Renosi, Florian ; Roggy, Anne ; Giguelay, Ambre ; Soret, Lou ; Viailly, Pierre-Julien ; Cheok, Meyling ; Biichle, Sabeha ; Angelot-Delettre, Fanny ; Asnafi, Vahid ; Macintyre, Elizabeth ; Geffroy, Sandrine ; Callanan, Mary ; Petrella, Tony ; Deconinck, Eric ; Daguindau, Etienne ; Harrivel, Véronique ; Bouyer, Sabrina ; Salaün, Véronique ; Saussoy, Pascale ; Feuillard, Jean ; Fuseau, Pascal ; Saas, Philippe ; Adotévi, Olivier ; Jardin, Fabrice ; Ferrand, Christophe ; Preudhomme, Claude ; Colinge, Jacques ; Roumier, Christophe ; Garnache-Ottou, Francine ; Interactions hôte-greffon-tumeur, ingénierie cellulaire et génique - UFC (UMR INSERM 1098) (RIGHT) ; Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Etablissement français du sang Bourgogne-Franche-Comté (EFS BFC)-Université de Franche-Comté (UFC) ; Université Bourgogne Franche-Comté COMUE (UBFC)-Université Bourgogne Franche-Comté COMUE (UBFC) ; Etablissement Français du Sang de Bourgogne Franche-Comté (site de Dijon) (EFS BFC (site de Dijon)) ; Etablissement français du sang Bourgogne-Franche-Comté (EFS BFC) ; Institut du Cancer de Montpellier (ICM) ; Institut de Recherche en Cancérologie de Montpellier (IRCM - U1194 Inserm - UM) ; CRLCC Val d'Aurelle - Paul Lamarque-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Montpellier (UM) ; UNICANCER - Institut régional du Cancer Montpellier Val d'Aurelle (ICM) ; CRLCC Val d'Aurelle - Paul Lamarque ; Centre de Lutte Contre le Cancer Henri Becquerel Normandie Rouen (CLCC Henri Becquerel) ; Cancer Heterogeneity, Plasticity and Resistance to Therapies - UMR 9020 - U 1277 (CANTHER) ; Institut Pasteur de Lille ; Réseau International des Instituts Pasteur (RIIP)-Réseau International des Instituts Pasteur (RIIP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Lille-Centre Hospitalier Régional Universitaire Lille (CHRU Lille)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS) ; Laboratoire d'Excellence : Lipoprotéines et Santé : prévention et Traitement des maladies Inflammatoires et du Cancer (LabEx LipSTIC) ; Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques (UM2)-Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-École Pratique des Hautes Études (EPHE) ; Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Institut Gustave Roussy (IGR)-Centre Hospitalier Régional Universitaire de Nancy (CHRU Nancy)-Centre Hospitalier Régional Universitaire de Besançon (CHRU Besançon)-Université de Bourgogne (UB)-Centre Hospitalier Universitaire de Dijon - Hôpital François Mitterrand (CHU Dijon)-Centre Régional de Lutte contre le cancer Georges-François Leclerc Dijon (UNICANCER/CRLCC-CGFL) ; UNICANCER-UNICANCER-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Fédération Francophone de la Cancérologie Digestive, FFCD-Université de Montpellier (UM)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Etablissement français du sang Bourgogne-Franche-Comté (EFS BFC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Franche-Comté (UFC) ; Etablissement Français du Sang de Bourgogne Franche-Comté (site de Chalon-sur-Saône) (EFS BFC (site de Chalon-sur-Saône) ) ; EFS-Etablissement français du sang Bourgogne-Franche-Comté (EFS BFC) ; Institut Necker Enfants-Malades (INEM - UM 111 (UMR 8253 / U1151)) ; Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Cité (UPCité) ; Institute for Advanced Biosciences / Institut pour l'Avancée des Biosciences (Grenoble) (IAB) ; Centre Hospitalier Universitaire Grenoble (CHU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Etablissement français du sang - Auvergne-Rhône-Alpes (EFS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes (UGA) ; Equipe CADIR (LNC - U1231) ; Lipides - Nutrition - Cancer Dijon - U1231 (LNC) ; Université de Bourgogne (UB)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Université de Bourgogne (UB)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement ; Université du Québec à Montréal = University of Québec in Montréal (UQAM) ; Maisonneuve-Rosemont, Hôpital ; Amiens-Picardie, CHU ; Centre hospitalier universitaire de Poitiers (CHU Poitiers) ; Caen, CHU ; Normandie Université (NU)-Tumorothèque de Caen Basse-Normandie (TCBN) ; Cliniques universitaires St Luc Bruxelles ; Hôpital Dupuytren CHU Limoges ; CHU de la Martinique Fort de France ; Université de Montpellier (UM) |
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| Zeitschrift: | ISSN: 2473-9529, 2021 |
| Veröffentlichung: | HAL CCSD ; The American Society of Hematology, 2021 |
| Medientyp: | academicJournal |
| DOI: | 10.1182/bloodadvances.2020003359 |
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