Einzeltreffer — DigiBib

Loss of heterozygosity (LOH) of chromosomal regions is crucial in tumor progression. In this study we assessed the potential of the Affymetrix GeneChip HuSNP mapping assay for detecting genome-wide LOH in prostate tumors. We analyzed two human prostate cell lines, P69SV40Tag (P69) and its tumorigenic subline, M12, and 11 prostate cancer cases. The Ml 2 cells showed LOH in chromosomes 3p12.1-p22.I, 1lq22.1-q24.2, 19p13.12, and 19ql 3,42. All of the prostate cases with informative single-nucleotide polymorphism (SNP) markers showed LOH in lpi31.2, 10ql1.21, 12p13,1, 16q23.1-q23.2, 17p13.3, 17q21,31, and 21q21.2. Additionally, a high percentage of cases showed LOH at 6p25,1-p25.3 (75%), 8p22-p23.2, and 10q22.1 (70% Several tumor suppressor genes (TSGs) have been mapped in these loci. These results demonstrate that the HuSNP mapping assay can serve as an alternative to comparative genomic hybridization for assessing genome-wide LOH and can identify chromosomal regions harboring candidate TSGs implicated in prostate cancer.

Titel:	Genome-wide detection of LOH in prostate cancer using human SNP microarray technology
Autor/in / Beteiligte Person:	DUMUR, Catherine I ; DECHSUKHUM, Chavaboon ; WARE, Joy L ; COFIELD, Stacey S ; BEST, Al M ; WILKINSON, David S ; GARRETT, Carleton T ; FERREIRA-GONZALEZ, Andrea
Link:	E-Journal im Bestand der UB Hagen? View record from PASCAL Archive
Zeitschrift:	Genomics (San Diego, Calif.), Jg. 81 (2003), Heft 3, S. 260-269
Veröffentlichung:	San Diego, CA: Elsevier, 2003
Medientyp:	academicJournal
Umfang:	print, 45 ref
ISSN:	0888-7543 (print)
Schlagwort:	Cell biology, histology Biologie cellulaire, histologie Genetics Génétique Sciences biologiques et medicales Biological and medical sciences Sciences biologiques fondamentales et appliquees. Psychologie Fundamental and applied biological sciences. Psychology Biologie moleculaire et cellulaire Molecular and cellular biology Méthodes diverses Diverse techniques Appareil génital mâle pathologie Male genital diseases Aparato genital macho patología Appareil urinaire pathologie Urinary system disease Aparato urinario patología Prostate pathologie Prostate disease Prostata patología Biologie moléculaire Molecular biology Biología molecular Détection Detection Detección Génome Genome Genoma Homme Human Hombre Méthode étude Investigation method Método estudio Prostate Prostata Puce à DNA DNA chip Pulga de DNA Tumeur maligne Malignant tumor Tumor maligno LOH Oligonucleotide microarray SNP: Prostate cancer: Genome-wide
Sonstiges:	Nachgewiesen in: PASCAL Archive Sprachen: English Original Material: INIST-CNRS Document Type: Article File Description: text Language: English Author Affiliations: Department of Pathology, Virginia Commonwealth University, Richmond, VA 23298-0248, United States ; Department of Biostatistics, Virginia Commonwealth University, Richmond, VA 232980248, United States Rights: Copyright 2003 INIST-CNRS ; CC BY 4.0 ; Sauf mention contraire ci-dessus, le contenu de cette notice bibliographique peut être utilisé dans le cadre d’une licence CC BY 4.0 Inist-CNRS / Unless otherwise stated above, the content of this bibliographic record may be used under a CC BY 4.0 licence by Inist-CNRS / A menos que se haya señalado antes, el contenido de este registro bibliográfico puede ser utilizado al amparo de una licencia CC BY 4.0 Inist-CNRS Notes: Molecular and cell biology

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Genome-wide detection of LOH in prostate cancer using human SNP microarray technology