DNA sequence of the Escherichia coli O103 O antigen gene cluster and detection of enterohemorrhagic E. coli O103 by PCR amplification of the wzx and wzy genes

Le sérogroupe 0103 de Escherichia coli a été associé avec des maladies gastro-intestinales et le syndrome hémolytique urémique. Afin d'élaborer des méthodes de détection basée sur le PCR et d'identifier ce sérogroupe, la séquence d'ADN de la région de 12 033 pb contenant le groupe de gènes de l'antigène O d'Escherichia coli 0103 a été déterminée. Des 12 cadres de lecture ouverts identifiés, les gènes wzx (flippase de l'antigène O) et wzy (polymérase de l'antigène O) de E. coli 0103 ont été sélectionnés comme cibles pour l'élaboration des tests de PCR conventionnels et en temps réel spécifiques à ce sérogroupe. De plus, un PCR multiplex ciblant les gènes de la toxine Shiga 1 (stx1), de la toxine Shiga 2 (stx2) et de wzx et wzy fut conçu afin de différencier le E. coli 0103 produisant la Stx des souches non-toxinogènes. Les tests de PCR peuvent être employés afin d'identifier le sérogroupe 0103 de E. coli, remplaçant le sérotypage basé sur les antigènes, et de détecter potentiellement l'organisme dans les échantillons alimentaires, fécaux et environnementaux.