Utility of gel-free, label-free shotgun proteomics approaches to investigate microorganisms

PORTEUS, Bianca ; KOCHARUNCHITT, Chawalit ; et al.

In: Applied microbiology and biotechnology, Jg. 90 (2011), Heft 2, S. 407-416

Online academicJournal - print, 1 p.3/4

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This review will examine the current situation with label-free, quantitative, shotgun-oriented proteomics technology and discuss the advantages and limitations associated with its capability in capturing and quantifying large portions of proteomes of microorganisms. Such an approach allows (1) comparisons between physiological or genetic states of organisms at the protein level, (2) 'painting' of proteomic data onto genome data-based metabolic maps, (3) enhancement of the utility of genomic data and finally (4) surveying of non-genome sequenced microorganisms by taking advantage of available inferred protein data in order to gain new insights into strain-dependent metabolic or physiological capacities. The technology essentially is a powerful addition to systems biology with a capacity to be used to ask hypothesis-driven 'top-down' questions or for more empirical 'bottom-up' exploration.

Titel:	Utility of gel-free, label-free shotgun proteomics approaches to investigate microorganisms
Autor/in / Beteiligte Person:	PORTEUS, Bianca ; KOCHARUNCHITT, Chawalit ; NILSSON, Rolf E ; ROSS, Tom ; BOWMAN, John P
Link:	Volltext (PDF) View record from PASCAL Archive
Zeitschrift:	Applied microbiology and biotechnology, Jg. 90 (2011), Heft 2, S. 407-416
Veröffentlichung:	Heidelberg: Springer, 2011
Medientyp:	academicJournal
Umfang:	print, 1 p.3/4
ISSN:	0175-7598 (print)
Schlagwort:	Biotechnology Biotechnologies Microbiology, infectious diseases Microbiologie, maladies infectieuses Sciences biologiques et medicales Biological and medical sciences Sciences biologiques fondamentales et appliquees. Psychologie Fundamental and applied biological sciences. Psychology Biotechnologie Analyse quantitative Quantitative analysis Análisis cuantitativo Microorganisme Microorganism Microorganismo Protéine Protein Proteína Protéomique Proteomics Proteómica LTQ-orbitrap MudPIT Protein quantification Quantification Spectral counting
Sonstiges:	Nachgewiesen in: PASCAL Archive Sprachen: English Original Material: INIST-CNRS Document Type: Article File Description: text Language: English Author Affiliations: Tasmanian Institute of Agricultural Research, School of Agricultural Science, University of Tasmania, College Road, Sandy Bay, 7005, Hobart, Tasmania, Australia Rights: Copyright 2015 INIST-CNRS ; CC BY 4.0 ; Sauf mention contraire ci-dessus, le contenu de cette notice bibliographique peut être utilisé dans le cadre d’une licence CC BY 4.0 Inist-CNRS / Unless otherwise stated above, the content of this bibliographic record may be used under a CC BY 4.0 licence by Inist-CNRS / A menos que se haya señalado antes, el contenido de este registro bibliográfico puede ser utilizado al amparo de una licencia CC BY 4.0 Inist-CNRS Notes: Biotechnology

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