Ultra-High-Pressure RPLC Hyphenated to an LTQ-Orbitrap Velos Reveals a Linear Relation between Peak Capacity and Number of Identified Peptides

KÖCHER, Thomas ; SWART, Remco ; et al.

In: Analytical chemistry (Washington), Jg. 83 (2011), Heft 7, S. 2699-2704

academicJournal - print, 32 ref

Currently, unbiased protein identification is mostly performed by directly coupling reversed-phase liquid chromatography (RPLC) via electrospray ionization to a mass spectrometer. In contrast to the innovations in mass spectrometric instrumentation, cutting-edge technology in RPLC has generally not been well adopted. Here, we describe the effects of increased peak capacities on the number of identified proteins and peptides in complex mixtures utilizing collision-induced dissociation on an LTQ-Orbitrap Velos, providing a rationale for using advanced RPLC technology in LC-MS/MS. Using two different column lengths and gradient times between 1 and 10 h, we found a linear relation between the obtained peak capacities and the number of identified peptides. We identified on average 2516 proteins in the tryptic digest of 1 μg of HeLa lysate using an 8 h gradient on a 50 cm column packed with 2 μm C 18 reversed-phase chromatographic material.

Titel:	Ultra-High-Pressure RPLC Hyphenated to an LTQ-Orbitrap Velos Reveals a Linear Relation between Peak Capacity and Number of Identified Peptides
Autor/in / Beteiligte Person:	KÖCHER, Thomas ; SWART, Remco ; MECHTLER, Karl
Link:	E-Journal im Bestand der UB Hagen? View record from PASCAL Archive
Zeitschrift:	Analytical chemistry (Washington), Jg. 83 (2011), Heft 7, S. 2699-2704
Veröffentlichung:	Washington, DC: American Chemical Society, 2011
Medientyp:	academicJournal
Umfang:	print, 32 ref
ISSN:	0003-2700 (print)
Schlagwort:	Analytical chemistry Chimie analytique Sciences exactes et technologie Exact sciences and technology Chimie Chemistry Généralités, appareillage General, instrumentation Méthodes chromatographiques et méthodes physiques associées à la chromatographie Chromatographic methods and physical methods associated with chromatography Autres méthodes chromatographiques Other chromatographic methods Méthodes spectrométriques et optiques Spectrometric and optical methods Appareillage Instrumentation Instrumentación Chromatographie phase inverse Reversed phase chromatography Cromatografía fase inversa Chromatographie phase liquide Liquid chromatography Cromatografía fase líquida Colonne garnissage Packed column Columna de relleno Couplage Coupling Acoplamiento Dissociation Disociación Electrospray Gradient Gradiente Haute pression High pressure Alta presión Identification Identificación Ionisation chimique Chemical ionization Ionización química Lysat Lysate Lisado Mélange Mixture Mezcla Méthode couplée Coupled method Método acoplado Peptide Peptides Péptido Pic Peak Pico Protéine Protein Proteína Spectrométrie masse tandem Mass spectrometry MS/MS Espectrometría masa en tándem Spectrométrie masse Mass spectrometry Espectrometría masa Temps Time Tiempo
Sonstiges:	Nachgewiesen in: PASCAL Archive Sprachen: English Original Material: INIST-CNRS Document Type: Article File Description: text Language: English Author Affiliations: Research Institute of Molecular Pathology (IMP), Vienna, Austria ; Dionex Corporation, Amsterdam, Netherlands ; Institute of Molecular Biotechnology (IMBA), Vienna, Austria Rights: Copyright 2015 INIST-CNRS ; CC BY 4.0 ; Sauf mention contraire ci-dessus, le contenu de cette notice bibliographique peut être utilisé dans le cadre d’une licence CC BY 4.0 Inist-CNRS / Unless otherwise stated above, the content of this bibliographic record may be used under a CC BY 4.0 licence by Inist-CNRS / A menos que se haya señalado antes, el contenido de este registro bibliográfico puede ser utilizado al amparo de una licencia CC BY 4.0 Inist-CNRS Notes: Analytical chemistry

Klicken Sie ein Format an und speichern Sie dann die Daten oder geben Sie eine Empfänger-Adresse ein und lassen Sie sich per Email zusenden.

BibTeX Citavi, JabRef, u.a.
(Literaturverwaltung)

PDF kein Volltext!
(Merkzettel, Notizen)

RIS Endnote, Citavi u.a.
(Literaturverwaltung)

MODS
(XML zur Weiterverarbeitung)

oder

Wählen Sie das für Sie passende Zitationsformat und kopieren Sie es dann in die Zwischenablage, lassen es sich per Mail zusenden oder speichern es als PDF-Datei.

Gewünschter Zitations-Stil:

oder

Bitte prüfen Sie, ob die Zitation formal korrekt ist, bevor Sie sie in einer Arbeit verwenden. Benutzen Sie gegebenenfalls den "Exportieren"-Dialog, wenn Sie ein Literaturverwaltungsprogramm verwenden und die Zitat-Angaben selbst formatieren wollen.