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Crystalline FRAP complex

Clardy, Jon C. ; Choi, Jungwon
1999
Online Patent

Titel:
Crystalline FRAP complex
Autor/in / Beteiligte Person: Clardy, Jon C. ; Choi, Jungwon
Link:
Veröffentlichung: 1999
Medientyp: Patent
Sonstiges:
  • Nachgewiesen in: USPTO Patent Grants
  • Sprachen: English
  • Patent Number: 5,939,528
  • Publication Date: August 17, 1999
  • Appl. No: 08/963,601
  • Application Filed: October 31, 1997
  • Assignees: Cornell Research Foundation, Inc. (Ithaca, NY)
  • Claim: We claim
  • Claim: 1. An orthorhombic crystalline composition in the space group P2.sub.1 2.sub.1 2.sub.1 which diffracts X-rays at a resolution of 2.7 .ANG. or better, each asymmetric unit of which containing one complex comprising
  • Claim: (a) a first protein comprising a peptide sequence derived or selected from the peptide sequence of human FK506 binding protein 12 (FKBP12)
  • Claim: (b) a second protein comprising a peptide sequence derived or selected from the peptide sequence of an FKBP:rapamycin binding domain of human FKBP:Rapamycin Associated Protein (FRAP), and
  • Claim: (c) rapamycin or a rapamycin derivative capable of forming a ternary complex with the first and second proteins.
  • Claim: 2. The crystalline composition of claim 1, wherein the first protein comprises the peptide sequence of SEQ ID No. 1 and the second protein comprises the peptide sequence of SEQ ID No. 2.
  • Claim: 3. The composition of any of claims 1 or 2 in which the proteins of the complex are characterized by the coordinates of FIG. 4, or by coordinates having a root mean square deviation therefrom, with respect to conserved backbone atoms of the listed amino acids, of not more than 1.5 .ANG..
  • Current U.S. Class: 530/350; 536/231; 536/235
  • Current International Class: C07K 1447
  • Other References: Choi et al. "Structure of the FKBP12-Rapamycin complex interacting with the binding domain of human FRAP" Science 273, 239-242, Jul. 12, 1996. ; Van Duyne "Atomic structure of the human immunophilin FKBP-12 complex with FK506 and rapamycin" J. Mol. Biol. 229, 105-124, 1993. ; Wilson et al. Comparative X-ray structure of the major binding protein for the immunosuppressant FK506 . . . Acta Cryst. D51, 551-521, 1995.
  • Primary Examiner: Wax, Robert A.
  • Assistant Examiner: Nashed, Nashaat T.
  • Attorney, Agent or Firm: Berstein, David L.

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